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api request: asset blob id to asset/dandiset/version

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Evaluación

Dificultad
5/5
Tiempo estimado
Más de una semana
Aptitud para principiantes
35/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
python
Área
api

Línea de trabajo

Empieza rastreando cómo DandiAPIClient expone get_dandisets(), get_versions() y get_assets(), y dónde se definen las solicitudes de API. Compara el endpoint propuesto assets/blob/{blob_id}/ con el flujo existente de metadatos de assets. Se considera terminado cuando un ID de blob devuelve sus metadatos de asset, además de cada dandiset y versión que lo contienen, sin recorrer todos los dandisets.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

I need to build a map from asset blob id to dandiset(s). Currently, I am doing this by:

client = DandiAPIClient()

with shelve.open("asset_blob_to_dandiset") as db:
    for dandiset in tqdm(list(client.get_dandisets()), position=1):
        for version in tqdm(list(dandiset.get_versions()), position=2, leave=False):
            dandiset = client.get_dandiset(dandiset_id=dandiset.identifier, version_id=version.identifier)
            for asset in tqdm(list(dandiset.get_assets()), position=3, leave=False):
                blob_id = asset.zarr if ".zarr" in pathlib.Path(asset.path).suffixes else asset.blob
                db[blob_id] = dandiset.identifier

This works, but feels terrible inefficient because I really only need the map for a subset of assets, but since I don't know which dandisets they belong to I am forced to iterate over all of them in order to create a reverse map. It would be great if I could have an endpoint like assets/blob/{blob_id}/ which would return asset metadata. Ideally, this would include the ids of each dandiset that contains this asset and versions within each of those dandisets that contain this asset.

Lenguaje dominante
Python
Estrellas
29
Forks
37
Merge medio
1 d 5 h
PR fusionados (30 d)
20

Preparar el entorno

Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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