reduce computational cost
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Valutazione
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Idoneità per principianti
- 35/100
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Stato di attività
- Ferma
- Stack tecnologico
- python
- Ambito
- performance
Direzione di ricerca
Start by tracing the conformer-generation workflow through DFTB pruning, DFT shell optimization, and saddle-point searches. Define the staged workflow so loose-convergence energy checks remove high-energy conformers early and saddle-point searches run only on the remaining low-energy conformers; done means the workflow reduces computational cost without losing intended candidates.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
ideas to reduce computational cost:
- during shell minimizations, compare energies with loose convergence criteria to eliminate high energy conformers earlier in the process (don't run high energy conformers all the way down hill as they will be discarded anyways)
- only run saddle point searches on low energy conformers after shell optimization (instead of trying to find saddle points for all conformers)
- generate conformers --> prune with DFTB (low level) --> prune with DFT shell opt (high level) --> run saddle point searched on remaining conformers
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 51
- Fork
- 19
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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Conformer generation isn't deterministicForse di nuovo libera @sevyharris l’ha presa 596 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
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