Clarification of condition table what happens if NaN is provided as a value
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Valutazione
- Difficoltà
- 2/5
- Tempo stimato
- 1-3 ore
- Idoneità per principianti
- 35/100
- Tipo di issue
- Documentazione
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Stato di attività
- Ferma
- Ambito
- documentation
Direzione di ricerca
Start with the condition-table section in the linked PEtab documentation and review the related AMICI issue discussion. Determine the intended behavior when NaN is used for compartmentID and parameterID, then clarify the table and the sentence about overriding model parameter values so the documented behavior is unambiguous.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
I.e. on
https://petab.readthedocs.io/en/latest/documentation_data_format.html#condition-table
The NaN case is listed for speciesID but not for compartmentID and parameterID. It is unclear what happens here, but I assume the initial values of the model should be taken.
The sentence
the values will override any parameter values specified in the model.
reads for me, that you have to set the NaN.
See also discussion in https://github.com/AMICI-dev/AMICI/issues/1796
- Lingua principale
- Nessun dato sulla lingua
- Stelle
- 67
- Fork
- 16
- Merge medio
- 1g 19h
- PR unite (30g)
- 1
Preparare l'ambiente
- Nessun Dockerfile né file Docker Compose
- Nessun modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
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