Clarification of condition table what happens if NaN is provided as a value
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Evaluación
- Dificultad
- 2/5
- Tiempo estimado
- 1-3 horas
- Aptitud para principiantes
- 35/100
- Tipo de issue
- Documentación
- Claridad
- Bastante claro
- Estado de actividad
- Estancado
- Área
- documentation
Línea de trabajo
Start with the condition-table section in the linked PEtab documentation and review the related AMICI issue discussion. Determine the intended behavior when NaN is used for compartmentID and parameterID, then clarify the table and the sentence about overriding model parameter values so the documented behavior is unambiguous.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
I.e. on
https://petab.readthedocs.io/en/latest/documentation_data_format.html#condition-table
The NaN case is listed for speciesID but not for compartmentID and parameterID. It is unclear what happens here, but I assume the initial values of the model should be taken.
The sentence
the values will override any parameter values specified in the model.
reads for me, that you have to set the NaN.
See also discussion in https://github.com/AMICI-dev/AMICI/issues/1796
- Lenguaje dominante
- Sin datos de lenguaje
- Estrellas
- 67
- Forks
- 16
- Merge medio
- 5 d 9 h
- PR fusionados (30 d)
- 3
Preparar el entorno
- Sin Dockerfile ni archivo de Docker Compose
- Sin plantilla de pull request
- Leer la guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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