Clarification of condition table what happens if NaN is provided as a value
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Évaluation
- Difficulté
- 2/5
- Temps estimé
- 1-3 heures
- Accessibilité débutants
- 35/100
- Type d'issue
- Documentation
- Clarté
- Plutôt claire
- Activité
- À l'abandon
- Domaine
- documentation
Piste de recherche
Start with the condition-table section in the linked PEtab documentation and review the related AMICI issue discussion. Determine the intended behavior when NaN is used for compartmentID and parameterID, then clarify the table and the sentence about overriding model parameter values so the documented behavior is unambiguous.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Description
I.e. on
https://petab.readthedocs.io/en/latest/documentation_data_format.html#condition-table
The NaN case is listed for speciesID but not for compartmentID and parameterID. It is unclear what happens here, but I assume the initial values of the model should be taken.
The sentence
the values will override any parameter values specified in the model.
reads for me, that you have to set the NaN.
See also discussion in https://github.com/AMICI-dev/AMICI/issues/1796
- Langage dominant
- Aucune donnée de langage
- Étoiles
- 67
- Forks
- 16
- Merge moyen
- 1 j 19 h
- PR mergées (30 j)
- 1
Préparer son environnement
- Aucun Dockerfile ni fichier Docker Compose
- Aucun modèle de pull request
- Lire le guide de contribution
Par où commencer
- Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
- Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
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