Mapper export: add the CIEL concept behind each bridge match
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 58/100
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Chiarezza
- Specificata chiaramente
- Stato di attività
- Attiva
- Ambito
- data
Direzione di ricerca
The issue points to the CSV export, the __map_*__ column documentation, and the free-text __result_oclcielbridge_NN__ columns; no file or test is named. Start by locating the export code and its tests, then trace how bridge matches populate rows. Done when bridge rows export the concept id, name, URL, and map type, non-bridge rows leave those columns empty, and the new columns are documented.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
For a match found by the CIEL bridge, the CSV export has no column for the CIEL concept the match came through. It's only inside the free-text __result_oclcielbridge_NN__ columns, for example 112480:Severe sepsis --> [BROADER-THAN] --> ….
That concept is what lets a mapping flow on into other systems. OHDSI, for one, gets to OMOP through CIEL's vocabulary in Athena. Today a user has to parse it out of the free text.
Found while preparing the OHDSI 2026 Mapper demo (Mapper 1.0.31-beta).
Related: OpenConceptLab/ocl_issues#2507 (concept details missing from the export).
Acceptance criteria
- For a row whose mapped concept came via the bridge, the export has columns for the bridge concept (id, name, URL) and the bridge map type (e.g. SAME-AS, BROADER-THAN).
- They're empty for rows matched without the bridge.
- The columns are documented with the other
__map_*__export columns.
- Lingua principale
- Nessun dato sulla lingua
- Stelle
- 4
- Fork
- 2
- Merge medio
- 2h 12m
- PR unite (30g)
- 1
Preparare l'ambiente
- Nessun Dockerfile né file Docker Compose
- Nessun modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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