Mapper export: add the CIEL concept behind each bridge match

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#2,933 1 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới
58/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Đặc tả rõ ràng
Mức độ hoạt động
Sôi nổi
Lĩnh vực
data

Hướng nghiên cứu

The issue points to the CSV export, the __map_*__ column documentation, and the free-text __result_oclcielbridge_NN__ columns; no file or test is named. Start by locating the export code and its tests, then trace how bridge matches populate rows. Done when bridge rows export the concept id, name, URL, and map type, non-bridge rows leave those columns empty, and the new columns are documented.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

component/mapper decision/ai-ready signal/low-risk signal/well-specified stage/triaged type/feature

For a match found by the CIEL bridge, the CSV export has no column for the CIEL concept the match came through. It's only inside the free-text __result_oclcielbridge_NN__ columns, for example 112480:Severe sepsis --> [BROADER-THAN] --> ….

That concept is what lets a mapping flow on into other systems. OHDSI, for one, gets to OMOP through CIEL's vocabulary in Athena. Today a user has to parse it out of the free text.

Found while preparing the OHDSI 2026 Mapper demo (Mapper 1.0.31-beta).

Related: OpenConceptLab/ocl_issues#2507 (concept details missing from the export).

Acceptance criteria

  • For a row whose mapped concept came via the bridge, the export has columns for the bridge concept (id, name, URL) and the bridge map type (e.g. SAME-AS, BROADER-THAN).
  • They're empty for rows matched without the bridge.
  • The columns are documented with the other __map_*__ export columns.
Ngôn ngữ chính
Không có dữ liệu ngôn ngữ
Star
4
Fork
2
Merge trung bình
2 giờ 12 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
1

Chuẩn bị môi trường

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của OpenConceptLab/ocl_issues

Tất cả issue của OpenConceptLab/ocl_issues

Issue tương tự

Thêm issue về Data Engineering

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.