Mapper export: add the CIEL concept behind each bridge match

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評価

難易度
4/5
見積もり時間
3〜5日
初心者へのやさしさ
58/100
issue の種類
機能追加
明瞭さ
明確に書かれている
活発さ
活発
領域
data

調査の方向性

The issue points to the CSV export, the __map_*__ column documentation, and the free-text __result_oclcielbridge_NN__ columns; no file or test is named. Start by locating the export code and its tests, then trace how bridge matches populate rows. Done when bridge rows export the concept id, name, URL, and map type, non-bridge rows leave those columns empty, and the new columns are documented.

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

component/mapper decision/ai-ready signal/low-risk signal/well-specified stage/triaged type/feature

For a match found by the CIEL bridge, the CSV export has no column for the CIEL concept the match came through. It's only inside the free-text __result_oclcielbridge_NN__ columns, for example 112480:Severe sepsis --> [BROADER-THAN] --> ….

That concept is what lets a mapping flow on into other systems. OHDSI, for one, gets to OMOP through CIEL's vocabulary in Athena. Today a user has to parse it out of the free text.

Found while preparing the OHDSI 2026 Mapper demo (Mapper 1.0.31-beta).

Related: OpenConceptLab/ocl_issues#2507 (concept details missing from the export).

Acceptance criteria

  • For a row whose mapped concept came via the bridge, the export has columns for the bridge concept (id, name, URL) and the bridge map type (e.g. SAME-AS, BROADER-THAN).
  • They're empty for rows matched without the bridge.
  • The columns are documented with the other __map_*__ export columns.
主要言語
言語のデータがありません
スター
4
フォーク
2
平均マージ
2時間 12分
マージ済み PR(30日)
1

環境構築

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

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