Enable cli for humanization cdr grafting
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評価
- 難易度
- 5/5
- 見積もり時間
- 1週間以上
- 初心者へのやさしさ
- 25/100
- issue の種類
- 機能追加
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 活発さ
- 停滞
- 技術スタック
- python
- 領域
- bioinformatics, cli
調査の方向性
まず、人間化のために既存の web と CLI の経路を比較し、現在 CDR grafting がどのように公開されているかを確認します。完了の定義は、issue に記載されている共有呼び出しと入力／出力の分離処理が web ブラウザなしで機能し、CLI を通じて CDR grafting を実行できることとします。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
I would like to run the tool using the cli instead of the web browser. Specifically, I saw that running the humanization using cdr grafting is not an option currently. Is this a feature you would be interested in having?
I'm happy to work on implementing this, I would propose a two step process:
- Set up the cdr grafting with as minimal changes as possible
- Make an api for the calls that are made. Currently things between the cli and the web use very similar functions for the same features in the browser and in the cli. The functions should probably be structured in a way where both of them use the same methods, but have the web interface and the cli use different methods for parsing/(de)serialising input and output. This second point would be a lot of restructuring work, but would allow the two interfaces to stay in sink more easily.
- 主要言語
- Python
- スター
- 268
- フォーク
- 65
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
環境構築
- Dockerfile または Docker Compose ファイルあり
- プルリクエストのテンプレートなし
- コントリビューションガイドなし
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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