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Integrate ENERO Foundry ontologies into Semantic-SQL

Aperta
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#107 0 commenti 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

@cmungall ci sta già lavorando.

Dal 30/3/2026.

  • #108 di @cmungall — aperta

Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
48/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Tranquilla
Stack tecnologico
python, sql, sqlite
Ambito
databases

Direzione di ricerca

Inizia da src/semsql/builder/registry/ontologies.yaml, in particolare dalla voce oeo esistente, e verifica le ontologie candidate di ENERO per quanto riguarda gli URL di release, la serializzazione, gli imports e le licenze. Usa rdftab e relation-graph per convalidare le voci selezionate da un checkout pulito, quindi verifica che almeno un’ontologia oltre a oeo venga compilata correttamente e che i nuovi ID siano documentati.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

enhancement

Summary

Add first-class support for ENERO Foundry ontologies in Semantic-SQL so they can be built and downloaded the same way we handle other non-OBO ontologies.

The ENERO Foundry is positioning itself as a coordination layer for interoperable energy-domain ontologies, with early ontologies including OEO, CEPO, MENO, MUNO, OTO, and CHIO. Semantic-SQL already has a partial oeo entry in src/semsql/builder/registry/ontologies.yaml, but the broader ENERO set is not yet modeled here in a consistent way.

Why

  • Energy ontologies are increasingly relevant for FAIR research data workflows.
  • ENERO is explicitly trying to make these ontologies interoperable, which aligns well with SemSQL's SQL view layer over OWL/RDF.
  • The repo already supports a curated registry of non-OBO ontologies, so ENERO onboarding fits the existing architecture.

Proposed scope

  • Audit candidate ENERO ontologies for stable release URLs, serialization, imports, and licensing.
  • Decide which ontologies should be added to src/semsql/builder/registry/ontologies.yaml.
  • Add registry entries, prefixmaps, and any necessary build_command overrides.
  • Validate that each selected ontology can be turned into a working SemSQL SQLite build.
  • Add focused tests or documented smoke-test commands for the new entries.
  • Update user-facing docs so the new ontology IDs are discoverable.

Candidate ontologies

  • oeo (already present, likely needs validation/refresh)
  • cepo
  • meno
  • muno
  • oto
  • chio

Open questions

  • Which ENERO ontologies publish stable machine-readable release artifacts today?
  • Do any require non-default preprocessing before rdftab / relation-graph?
  • Should we stage this as oeo hardening first, then add the rest incrementally?
  • Are there any energy-adjacent artifacts we should explicitly exclude because they are not OWL reference ontologies in the SemSQL sense?

Acceptance criteria

  • At least one additional ENERO ontology beyond oeo is integrated end-to-end in the registry.
  • The oeo entry is verified or corrected against the current upstream release layout.
  • New entries are documented and reproducible from a clean checkout.
Lingua principale
Python
Stelle
70
Fork
7
Merge medio
4h 18m
PR unite (30g)
1

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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