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Integrate ENERO Foundry ontologies into Semantic-SQL

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@cmungall ya está trabajando en esto.

Desde el 30/3/2026.

  • #108 de @cmungall — abierto

Evaluación

Dificultad
4/5
Tiempo estimado
3-5 días
Aptitud para principiantes
48/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Tranquilo
Stack tecnológico
python, sql, sqlite
Área
databases

Línea de trabajo

Empieza con src/semsql/builder/registry/ontologies.yaml, especialmente con la entrada oeo existente, y audita las ontologías candidatas de ENERO en cuanto a URLs de lanzamiento, serialización, imports y licencias. Usa rdftab y relation-graph para validar las entradas seleccionadas desde un checkout limpio, y comprueba después que al menos una ontología además de oeo se construya correctamente y que los nuevos IDs estén documentados.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

enhancement

Summary

Add first-class support for ENERO Foundry ontologies in Semantic-SQL so they can be built and downloaded the same way we handle other non-OBO ontologies.

The ENERO Foundry is positioning itself as a coordination layer for interoperable energy-domain ontologies, with early ontologies including OEO, CEPO, MENO, MUNO, OTO, and CHIO. Semantic-SQL already has a partial oeo entry in src/semsql/builder/registry/ontologies.yaml, but the broader ENERO set is not yet modeled here in a consistent way.

Why

  • Energy ontologies are increasingly relevant for FAIR research data workflows.
  • ENERO is explicitly trying to make these ontologies interoperable, which aligns well with SemSQL's SQL view layer over OWL/RDF.
  • The repo already supports a curated registry of non-OBO ontologies, so ENERO onboarding fits the existing architecture.

Proposed scope

  • Audit candidate ENERO ontologies for stable release URLs, serialization, imports, and licensing.
  • Decide which ontologies should be added to src/semsql/builder/registry/ontologies.yaml.
  • Add registry entries, prefixmaps, and any necessary build_command overrides.
  • Validate that each selected ontology can be turned into a working SemSQL SQLite build.
  • Add focused tests or documented smoke-test commands for the new entries.
  • Update user-facing docs so the new ontology IDs are discoverable.

Candidate ontologies

  • oeo (already present, likely needs validation/refresh)
  • cepo
  • meno
  • muno
  • oto
  • chio

Open questions

  • Which ENERO ontologies publish stable machine-readable release artifacts today?
  • Do any require non-default preprocessing before rdftab / relation-graph?
  • Should we stage this as oeo hardening first, then add the rest incrementally?
  • Are there any energy-adjacent artifacts we should explicitly exclude because they are not OWL reference ontologies in the SemSQL sense?

Acceptance criteria

  • At least one additional ENERO ontology beyond oeo is integrated end-to-end in the registry.
  • The oeo entry is verified or corrected against the current upstream release layout.
  • New entries are documented and reproducible from a clean checkout.
Lenguaje dominante
Python
Estrellas
70
Forks
7
Merge medio
4 h 18 min
PR fusionados (30 d)
1

Preparar el entorno

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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