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Arcadia-Science
22 repository indicizzati · Vedi su GitHub
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agentic-pymol
A Model Context Protocol (MCP) server that exposes PyMOL as a typed tool surface to your agent (Claude Code/Desktop, Codex, or any MCP-co...
Python · 104 stelle
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glass-box-umap
Python package for making UMAP interpretable with exact feature contributions
Python · 55 stelle
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ProteinCartography
A pipeline to build similarity maps of protein space
Jupyter Notebook · 49 stelle
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noveltree
NovelTree is a highly parallelized and computationally efficient phylogenomic workflow that infers gene families, gene family trees, spec...
Nextflow · 27 stelle
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data-hub
Data Hub makes lab instrument data instantly accessible to people, pipelines, and agents
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Lua · 10 stelle
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2024-auto-openraman
Python package for automation and extension of OpenRaman
Python · 9 stelle
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arcadia-pycolor
Python package for styling plots according to Arcadia's style guide
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arcadia-microscopy-tools
High-throughput microscopy image analysis toolkit
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2025-raman-spectrometer-comparison
Repo for the notebook pub "Comparison of spontaneous Raman spectrometers"
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2024-organismal-selection
Code associated with the pub "Leveraging evolution to identify novel organismal models of human biology"
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cloud-scaled-cell-phenotyping
Notebook pub for scaling single-cell phenotyping with Cellpose-SAM and cloud GPUs.
Jupyter Notebook · 0 stelle
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R · 0 stelle
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2024-sensory-neuroimaging
Data analysis scripts and notebooks for the translation pilot "Label-free neuroimaging in mice captures sensory activity in response to t...
Python · 0 stelle
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2024-chlamy-mutant-motility-pub
Collection of data, code, scripts, and notebooks accompanying the pub "Rescuing Chlamydomonas Motility in Mutants Modeling Spermatogenic ...
Jupyter Notebook · 0 stelle
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Python · 0 stelle
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2023-actin-embedding
test repository for generating embedding space for actins
Jupyter Notebook · 0 stelle
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Jupyter Notebook · 0 stelle
- 2 altri repository si trovano su Vedi su GitHub
Le issue su cui forse qualcuno sta già lavorando sono in fondo alla lista. Ordina tutto per data
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Difficoltà 1/5 1-3 ore Idoneità per principianti 88/100
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pub-code-check
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
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pub-code-check
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 55/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 52/100
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Add support for Python 3.14Apertaenhancement
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 42/100
Arcadia-Science/glass-box-umap#23 · 1 commento ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
Arcadia-Science/agentic-pymol#8 · 3 commenti ·
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Plugin Manager GUI crash when installing on PyMOL 3.1.0 shipped with PyQt6Forse di nuovo libera @ekiefl l’ha presa 140 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
Arcadia-Science/agentic-pymol#3 · 9 commenti · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100
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SVG exports with mathtext render incorrectly in browsers and VSCodeForse di nuovo libera @Robert-Roth l’ha presa 154 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
Arcadia-Science/arcadia-pycolor#95 · 1 assegnatario ·
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Needs py.typedAperta
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100
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Add CHANGELOG.mdAperta
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 64/100
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 68/100
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bug
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 55/100
Arcadia-Science/noveltree#105 ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100
Arcadia-Science/2024-auto-openraman#41 · 1 commento ·
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100
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Reproducibility checkerAperta
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 42/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 55/100
Arcadia-Science/notebook-pub-template#39 · 2 commenti ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 28/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100
Arcadia-Science/notebook-pub-template#34 · 1 commento ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 38/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 38/100
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100
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Document arudino filesAperta
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 42/100
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documentation
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 68/100
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Would be nice to have guidance on nice color pairs/tripletsForse di nuovo libera @mezarque l’ha presa 548 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
Arcadia-Science/arcadia-pycolor#77 · 3 commenti · 2 assegnatari ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100
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bug
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 50/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
Arcadia-Science/notebook-pub-template#8 · 3 commenti ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
Arcadia-Science/arcadia-pycolor#62 · 3 commenti · 1 reazione ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100
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enhancement
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
Arcadia-Science/noveltree#103 ·
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Alignment process is failingApertabug
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100
Arcadia-Science/noveltree#102 ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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enhancement
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100
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enhancement good first issue
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100
Arcadia-Science/arcadia-pycolor#34 · 1 commento ·
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question
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 42/100
Arcadia-Science/arcadia-pycolor#25 · 4 commenti ·
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enhancement
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
Arcadia-Science/arcadia-pycolor#17 · 1 commento ·