Arcadia-Science

Les issues sur lesquelles quelqu’un travaille peut-être déjà sont listées en dernier. Tout trier par date

• Document updating the publication date as the final step before release

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 1/5 1-3 heures Accessibilité débutants 88/100

  Arcadia-Science/notebook-pub-template#47 · Ouverte le 27/10/2026

• Reproducibility Review (main)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler
  pub-code-check

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

  Arcadia-Science/2025-GFP-variant-design#8 · Ouverte le 21/10/2026

• Reproducibility Review (main)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler
  pub-code-check

  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  Arcadia-Science/2024-organismal-selection#8 · Ouverte le 21/10/2026

• Reproducibility Review (main)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 30/100

  Arcadia-Science/phenotypic-geometry#1 · Ouverte le 21/9/2026

• Reproducibility Review (main)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 55/100

  Arcadia-Science/FPguide#5 · Ouverte le 3/9/2026

• Reproducibility Review (main)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 52/100

  Arcadia-Science/arcadia-info-standardization#3 · Ouverte le 26/8/2026

• Add support for Python 3.14

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler
  enhancement

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 42/100

  Arcadia-Science/glass-box-umap#23 · 1 commentaire · Ouverte le 22/6/2026

• MCP server in WSL can't connect to PyMOL running on Windows

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

  Arcadia-Science/agentic-pymol#8 · 3 commentaires · Ouverte le 12/6/2026

• Plugin Manager GUI crash when installing on PyMOL 3.1.0 shipped with PyQt6

  Peut-être à nouveau libre @ekiefl l’a pris il y a 140 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Arcadia-Science/agentic-pymol#3 · 9 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 10/6/2026

• Reproducibility Review (repo-standards-cleanup)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 55/100

  Arcadia-Science/cayman-his-elisa-opentrons-workflow#17 · Ouverte le 1/6/2026

• SVG exports with mathtext render incorrectly in browsers and VSCode

  Peut-être à nouveau libre @Robert-Roth l’a pris il y a 155 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Arcadia-Science/arcadia-pycolor#95 · 1 personne assignée · Ouverte le 26/5/2026

• Needs py.typed

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 45/100

  Arcadia-Science/glass-box-umap#18 · Ouverte le 18/5/2026

• Add CHANGELOG.md

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 45/100

  Arcadia-Science/glass-box-umap#17 · Ouverte le 16/5/2026

• Bokeh embedding should have an export option

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  Arcadia-Science/glass-box-umap#16 · Ouverte le 16/5/2026

• Reproducibility Review (main)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 64/100

  Arcadia-Science/cayman-his-elisa-opentrons-workflow#16 · Ouverte le 15/5/2026

• Reproducibility Review (main)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 68/100

  Arcadia-Science/cayman-his-elisa-opentrons-workflow#12 · Ouverte le 29/4/2026

• wget attempted for s3 input paths

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler
  bug

  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 55/100

  Arcadia-Science/noveltree#105 · Ouverte le 20/4/2026

• Reproducibility Review (ik/address-repro-check)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 48/100

  Arcadia-Science/2024-auto-openraman#41 · 1 commentaire · Ouverte le 10/4/2026

• Reproducibility Review (ik/address-repro-check)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 72/100

  Arcadia-Science/2024-auto-openraman#40 · Ouverte le 10/4/2026

• Reproducibility checker

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

  Arcadia-Science/2024-auto-openraman#38 · Ouverte le 10/4/2026

• Reproducibility re-Review (ik/address-repro-issues)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 42/100

  Arcadia-Science/2024-sensory-neuroimaging#51 · Ouverte le 9/4/2026

• Reproducibility Review (bb_fixes)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

  Arcadia-Science/2024-ProteinCartography-dCK-validation#4 · Ouverte le 8/4/2026

• Reproducibility Review (bb_fixes)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

  Arcadia-Science/2024-ProteinCartography-dCK-validation#3 · Ouverte le 8/4/2026

• Reproducibility Review (main)

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 48/100

  Arcadia-Science/cayman-his-elisa-opentrons-workflow#1 · Ouverte le 27/2/2026

• There should be explicit instructions to not use matplotlib subplots

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 55/100

  Arcadia-Science/notebook-pub-template#39 · 2 commentaires · Ouverte le 2/2/2026

• It is a hassle to write fig-alt for each figure

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 28/100

  Arcadia-Science/notebook-pub-template#36 · Ouverte le 30/1/2026

• Consider torch.float16 casting for cellpose segmentation workflows

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 30/100

  Arcadia-Science/arcadia-microscopy-tools#29 · Ouverte le 9/1/2026

• Long math equations push the right viewport boundary on mobile

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

  Arcadia-Science/notebook-pub-template#34 · 1 commentaire · Ouverte le 17/11/2025

• Plotly figures are not displayed in marimo notebooks after setup call

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 38/100

  Arcadia-Science/arcadia-pycolor#88 · Ouverte le 28/10/2025

• Output figures are cropped when output with `apc.mpl.save_figure()`

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 38/100

  Arcadia-Science/arcadia-pycolor#86 · Ouverte le 27/8/2025

• Add an `--env` CLI param to `autoopenraman` command

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 45/100

  Arcadia-Science/2024-auto-openraman#31 · Ouverte le 17/6/2025

• Create AutoOpenRamanProfile config within tests to automate testing

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 48/100

  Arcadia-Science/2024-auto-openraman#30 · Ouverte le 17/6/2025

• Document arudino files

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 42/100

  Arcadia-Science/2024-auto-openraman#28 · Ouverte le 13/6/2025

• Write user guide for styling Plotly figures

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler
  documentation

  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 68/100

  Arcadia-Science/arcadia-pycolor#83 · Ouverte le 29/5/2025

• Would be nice to have guidance on nice color pairs/triplets

  Peut-être à nouveau libre @mezarque l’a pris il y a 548 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Arcadia-Science/arcadia-pycolor#77 · 3 commentaires · 2 personnes assignées · Ouverte le 28/4/2025

• Write git commit ID to metadata

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 25/100

  Arcadia-Science/2024-auto-openraman#22 · Ouverte le 28/3/2025

• Some tests are failing under certain conditions

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler
  bug

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 50/100

  Arcadia-Science/arcadia-pycolor#65 · Ouverte le 11/3/2025

• Sporadic `make execute` error: `ERROR: No such file or directory: '<REPO_ROOT>/index.html'`

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

  Arcadia-Science/notebook-pub-template#8 · 3 commentaires · Ouverte le 6/3/2025

• A dashboard for all colors/palettes/gradients?

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  Arcadia-Science/arcadia-pycolor#62 · 3 commentaires · 1 réaction · Ouverte le 27/2/2025

• Save spectrum image along with data and csv

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 15/100

  Arcadia-Science/2024-auto-openraman#16 · Ouverte le 18/11/2024

• Separate MM metadata from non-MM metadata

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 20/100

  Arcadia-Science/2024-auto-openraman#15 · Ouverte le 18/11/2024

• Enable testing with any profile

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100

  Arcadia-Science/2024-auto-openraman#13 · Ouverte le 11/11/2024

• Remove unused cell trajectory data

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 45/100

  Arcadia-Science/2024-chlamy-mutant-motility-pub#13 · Ouverte le 30/10/2024

• Intermediate file compression and/or storage utilization forecasting

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler
  enhancement

  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  Arcadia-Science/noveltree#103 · Ouverte le 14/10/2024

• Alignment process is failing

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler
  bug

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

  Arcadia-Science/noveltree#102 · Ouverte le 10/9/2024

• Integrate `stats_testing.py` into `arcadia_pycolor`

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler

  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  Arcadia-Science/2024-chlamy-mutant-motility-pub#1 · Ouverte le 13/8/2024

• Filter the PDFs generated by the plotting tests

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler
  enhancement

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100

  Arcadia-Science/arcadia-pycolor#39 · Ouverte le 3/7/2024

• Add utility that scales legend markers *after* legend creation

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler
  enhancement good first issue

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

  Arcadia-Science/arcadia-pycolor#34 · 1 commentaire · Ouverte le 1/7/2024

• Should palettes be iterables?

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler
  question

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 42/100

  Arcadia-Science/arcadia-pycolor#25 · 4 commentaires · Ouverte le 14/6/2024

• Add ability to reverse and slice gradients

  Ouverte

  ⋯Signaler un problème avec cette issue

  • Quelque chose ne va pas ?

  • Déjà prise
  • Pas adaptée aux débutants
  • Obsolète ou invalide
  • Autre chose…
  • Envoyer Annuler
  enhancement

  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  Arcadia-Science/arcadia-pycolor#17 · 1 commentaire · Ouverte le 31/5/2024