Check reproducibility of Steinbock and NanoString notebooks on Windows
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Évaluation
- Difficulté
- 4/5
- Temps estimé
- 3-5 jours
- Accessibilité débutants
- 30/100
- Type d'issue
- Bug
- Clarté
- À clarifier
- Activité
- À l'abandon
- Stack technique
- jupyter-notebook
- Domaine
- operating-systems, testing
Piste de recherche
Commencez par exécuter les notebooks Steinbock et NanoString sous Windows et examinez les issues spatialdata-io et spatialdata liées pour vérifier le comportement des chemins signalé. Comparez les chemins AnnData et les sorties des notebooks obtenus avec les résultats attendus ; le travail est considéré comme terminé lorsque le problème de reproductibilité est confirmé et que les étapes ou chemins concernés des notebooks sont identifiés.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Description
As reported here for Steinbock (https://github.com/scverse/spatialdata-io/issues/129) and here for NanoString (https://github.com/scverse/spatialdata/issues/637), it looks like that / in paths (I guess inside one of the AnnData objects), create reproducibility issues on Windows machine.
- Langage dominant
- Jupyter Notebook
- Étoiles
- 67
- Forks
- 26
- Métriques de merge des PR
- Aucune PR mergée en 30 j
Préparer son environnement
Ce projet ne fournit ni conteneur de développement, ni Dockerfile, ni guide de contribution : l'installation est à votre charge. Commencez par son README, et consultez notre guide de la première contribution pour les étapes générales.
Par où commencer
- Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
- Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
- Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
- Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.
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