Check reproducibility of Steinbock and NanoString notebooks on Windows
还没有人认领这个 Issue。
评估
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 新手友好度
- 30/100
- Issue 类型
- 缺陷
- 描述清晰度
- 需要澄清
- 活跃度
- 停滞
- 技术栈
- jupyter-notebook
调研方向
首先在 Windows 上运行 Steinbock 和 NanoString notebook，并查看链接的 spatialdata-io 和 spatialdata issue，以了解所报告的路径行为。将得到的 AnnData 路径和 notebook 输出与预期结果进行比较；确认可复现性问题并确定受影响的 notebook 步骤或路径后，即视为完成。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
As reported here for Steinbock (https://github.com/scverse/spatialdata-io/issues/129) and here for NanoString (https://github.com/scverse/spatialdata/issues/637), it looks like that / in paths (I guess inside one of the AnnData objects), create reproducibility issues on Windows machine.
- 主要语言
- Jupyter Notebook
- 星标
- 67
- 派生
- 26
- 平均合并
- 4 分钟
- 30 天内合并 PR
- 1
环境准备
我们还没有检查这个项目的环境配置文件。先看它的 README，通用步骤见我们的新手贡献指南。
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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