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LD_LIBRARY_PATH is not properly exported

Ouverte
#1,515 6 commentaires 0 réactions 0 personnes assignées Voir sur GitHub

Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

Personne n'a encore pris cette issue.

Évaluation

Difficulté
4/5
Temps estimé
3-5 jours
Accessibilité débutants
30/100
Type d'issue
Bug
Clarté
À clarifier
Activité
À l'abandon
Stack technique
linux, r, vscode

Piste de recherche

Comparez l’environnement d’une session R attachée avec celui de la session R lancée manuellement, en commençant par Sys.getenv("LD_LIBRARY_PATH") et l’erreur de chargement de la bibliothèque partagée. Examinez .vscode-server/extensions/reditorsupport.r-2.8.2/R/session/init.R et le chemin d’attach ; la tâche est terminée lorsque la session R attachée peut charger correctement la même bibliothèque sans l’erreur GLIBCXX.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

bug

Describe the bug
Attaching R doesn't properly sets LD_LIBRARY_PATH (it leads to errors when loading libraries). When I lunch R from system (the same one which I specify in r.path and r.term) has additional libraries on path as compared to attached R. I tried to update the LD_LIBRARY_PATH in .vscode-server/extensions/reditorsupport.r-2.8.2/R/session/init.R. when I attach R afterwards Sys.getenv("LD_LIBRARY_PATH") give updated LD_LIBRARY_PATH, however it seems like the libraries are still not accessible and the same error persist:

unable to load shared object 'proj/renv/library/R-4.3/x86_64-pc-linux-gnu/igraph/libs/igraph.so':
  /lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.29' not found (required by /proj/renv/library/R-4.3/x86_64-pc-linux-gnu/igraph/libs/igraph.so)

loading libraries in manualy launched R works with no errors.

To Reproduce

Can you fix this issue by yourself? (We appreciate the help)
No

Environment (please complete the following information):

  • OS: Linux
  • VSCode Version: 1.88.1
  • R Version: 4.3.3
  • vscode-R version: 2.8.2

Thank you and kind regards,
Amel

Langage dominant
TypeScript
Étoiles
1.2k
Forks
139
Merge moyen
20 h 32 min
PR mergées (30 j)
25

Préparer son environnement

Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
  3. Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
  4. Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

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