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LD_LIBRARY_PATH is not properly exported

Abierto
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Los mantenedores suelen responder en 1 día

Nadie ha tomado este issue todavía.

Evaluación

Dificultad
4/5
Tiempo estimado
3-5 días
Aptitud para principiantes
30/100
Tipo de issue
Error
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
linux, r, vscode

Línea de trabajo

Compara el entorno de una sesión de R adjunta con el de la sesión de R iniciada manualmente, comenzando por Sys.getenv("LD_LIBRARY_PATH") y el error de carga de la biblioteca compartida. Inspecciona .vscode-server/extensions/reditorsupport.r-2.8.2/R/session/init.R y la ruta de attach; se considera terminado cuando la R adjunta pueda cargar correctamente la misma biblioteca sin el error GLIBCXX.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

bug

Describe the bug
Attaching R doesn't properly sets LD_LIBRARY_PATH (it leads to errors when loading libraries). When I lunch R from system (the same one which I specify in r.path and r.term) has additional libraries on path as compared to attached R. I tried to update the LD_LIBRARY_PATH in .vscode-server/extensions/reditorsupport.r-2.8.2/R/session/init.R. when I attach R afterwards Sys.getenv("LD_LIBRARY_PATH") give updated LD_LIBRARY_PATH, however it seems like the libraries are still not accessible and the same error persist:

unable to load shared object 'proj/renv/library/R-4.3/x86_64-pc-linux-gnu/igraph/libs/igraph.so':
  /lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.29' not found (required by /proj/renv/library/R-4.3/x86_64-pc-linux-gnu/igraph/libs/igraph.so)

loading libraries in manualy launched R works with no errors.

To Reproduce

Can you fix this issue by yourself? (We appreciate the help)
No

Environment (please complete the following information):

  • OS: Linux
  • VSCode Version: 1.88.1
  • R Version: 4.3.3
  • vscode-R version: 2.8.2

Thank you and kind regards,
Amel

Lenguaje dominante
TypeScript
Estrellas
1.2k
Forks
139
Merge medio
20 h 32 min
PR fusionados (30 d)
25

Preparar el entorno

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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