LD_LIBRARY_PATH is not properly exported
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評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 30/100
- issue の種類
- バグ
- 明瞭さ
- 説明が足りない
- 活発さ
- 停滞
- 技術スタック
- linux, r, vscode
調査の方向性
接続された R セッションの環境を手動で起動した R セッションと比較し、まず Sys.getenv("LD_LIBRARY_PATH") と共有ライブラリの読み込みエラーを確認します。.vscode-server/extensions/reditorsupport.r-2.8.2/R/session/init.R と attach 経路を調査します。接続された R が GLIBCXX エラーなしで同じライブラリを正常に読み込めれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Describe the bug
Attaching R doesn't properly sets LD_LIBRARY_PATH (it leads to errors when loading libraries). When I lunch R from system (the same one which I specify in r.path and r.term) has additional libraries on path as compared to attached R. I tried to update the LD_LIBRARY_PATH in .vscode-server/extensions/reditorsupport.r-2.8.2/R/session/init.R. when I attach R afterwards Sys.getenv("LD_LIBRARY_PATH") give updated LD_LIBRARY_PATH, however it seems like the libraries are still not accessible and the same error persist:
unable to load shared object 'proj/renv/library/R-4.3/x86_64-pc-linux-gnu/igraph/libs/igraph.so':
/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.29' not found (required by /proj/renv/library/R-4.3/x86_64-pc-linux-gnu/igraph/libs/igraph.so)
loading libraries in manualy launched R works with no errors.
To Reproduce
Can you fix this issue by yourself? (We appreciate the help)
No
Environment (please complete the following information):
- OS: Linux
- VSCode Version: 1.88.1
- R Version: 4.3.3
- vscode-R version: 2.8.2
Thank you and kind regards,
Amel
- 主要言語
- TypeScript
- スター
- 1.2k
- フォーク
- 139
- 平均マージ
- 22時間
- マージ済み PR（30日）
- 23
環境構築
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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