Improve error handling in Problem.from_yaml - format_version
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Évaluation
- Difficulté
- 2/5
- Temps estimé
- 1-3 heures
- Accessibilité débutants
- 45/100
Piste de recherche
Start at the Problem.from_yaml entry point and reproduce the failure with a YAML file missing format_version. Trace the existing version validation and error handling, then make the missing field produce a proper error instead of KeyError; done means the reported case has a clear error and the relevant checks pass.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Description
Missing format_version in the yaml file should provide a proper error message instead of just KeyError:
--> 250 if yaml_config[FORMAT_VERSION] not in {"1", 1, "1.0.0", "2.0.0"}:
251 raise ValueError("Provided PEtab files are of unsupported version "
252 f"{yaml_config[FORMAT_VERSION]}. Expected "
253 f"{format_version.__format_version__}.")
254 if yaml_config[FORMAT_VERSION] == "2.0.0":
KeyError: 'format_version'
- Langage dominant
- Python
- Étoiles
- 18
- Forks
- 9
- Merge moyen
- 1 j 8 h
- PR mergées (30 j)
- 21
Préparer son environnement
- Aucun Dockerfile ni fichier Docker Compose
- Aucun modèle de pull request
- Lire le guide de contribution
Par où commencer
- Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
- Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
- Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
- Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.
Autres issues de PEtab-dev/libpetab-python
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`petab1to2`: random column name for pre-existing `experimentId` columnPeut-être pris Une pull request liée à cette issue est ouverte ou déjà fusionnée. Ouverte
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PEtab-dev/libpetab-python#568 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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`petab_files_1to2` keeps a stale model file when converting into a non-empty output directoryOuverte
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 73/100
PEtab-dev/libpetab-python#566 ·
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PEtab-dev/libpetab-python#549 ·
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PEtab-dev/libpetab-python#525 ·
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Deprecation warnings with pandas 3.1 (`inplace`, `read_csv(float_precision=...)`)Peut-être pris @dweindl l’a pris il y a 3 jours. Ouverte
PEtab-dev/libpetab-python#570 · 1 personne assignée ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
Toutes les issues de PEtab-dev/libpetab-python
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