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Improve error handling in Problem.from_yaml - format_version

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Los mantenedores suelen responder en 1 día

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Evaluación

Dificultad
2/5
Tiempo estimado
1-3 horas
Aptitud para principiantes
45/100
Tipo de issue
Error
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
python
Área
data

Línea de trabajo

Start at the Problem.from_yaml entry point and reproduce the failure with a YAML file missing format_version. Trace the existing version validation and error handling, then make the missing field produce a proper error instead of KeyError; done means the reported case has a clear error and the relevant checks pass.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

v1 validation

Missing format_version in the yaml file should provide a proper error message instead of just KeyError:

--> 250 if yaml_config[FORMAT_VERSION] not in {"1", 1, "1.0.0", "2.0.0"}:
    251     raise ValueError("Provided PEtab files are of unsupported version "
    252                      f"{yaml_config[FORMAT_VERSION]}. Expected "
    253                      f"{format_version.__format_version__}.")
    254 if yaml_config[FORMAT_VERSION] == "2.0.0":

KeyError: 'format_version'
Lenguaje dominante
Python
Estrellas
18
Forks
9
Merge medio
2 d 4 h
PR fusionados (30 d)
30

Preparar el entorno

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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