Reshaping Array

Ouverte

#47 ouverte le 27/6/2019 19 commentaires 0 réactions 1 personne assignée Voir sur GitHub

@hpages y travaille déjà.

Depuis le 9/7/2019.

Évaluation

Cette issue n'a pas encore été évaluée.

Description

First, thanks for the package. It's exactly what we needed. We're working on neuroimaging data: https://github.com/muschellij2/niftiArray. We're trying to do statistics over multiple 3D arrays. I believe this doesn't fit well with DelayedMatrixStats as matrixStats requires 2D matrices.

Similar to https://github.com/Bioconductor/DelayedArray/issues/30 and the comment here https://github.com/Bioconductor/DelayedArray/issues/30#issuecomment-423683637, I was wondering about "reshaping" an array. Really, I want to be able to vectorize a DelayedArray or convert a 4D DelayedArray to a 2D matrix where the first 3 dimensions are the rows of the matrix and the 4th dimension is the columns. I can realize the array, convert to a matrix, and then create a DelayedArray or DelayedMatrix for the current solution.

Ideally, I'd be able to do this without realizing the array into memory. I'm not sure if HDF5 (the backend we're using) would support this, but we would it useful. Trying to set dim or change the dimensions fails due the (correct) checks on DelayedMatrix. Just wondering if it were possible, if it makes sense with HDF5, and if both are true, then would it be possible to implement? I can send a reprex if necessary, but the setting of dimensions is well documented.

Langage dominant: R
Étoiles: 29
Forks: 12
Métriques de merge des PR: Aucune PR mergée en 30 j

Guide de contribution

Aucun guide de contribution indexé pour ce dépôt

Par où commencer

Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

Autres issues de Bioconductor/DelayedArray

Conversion to dgCMatrix Causes Segmentation Fault Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 38/100

Bioconductor/DelayedArray#129 · 11 commentaires · Ouverte le 10/9/2026
Custom delayed operations Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

Bioconductor/DelayedArray#127 · 1 commentaire · Ouverte le 22/5/2026
the supplied seed must support extract_array() Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

Bioconductor/DelayedArray#125 · 1 commentaire · Ouverte le 13/10/2025
Summation of ConstantArray of 0 with vector of 0's fails Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100

Bioconductor/DelayedArray#123 · Ouverte le 5/3/2025
Proposal to migrate `DelayedMask` to the DelayedArray package Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

Bioconductor/DelayedArray#122 · Ouverte le 23/1/2025

Toutes les issues de Bioconductor/DelayedArray

Issues similaires

CVar() passes actual and fitted values to accuracy() in the wrong order Ouverte

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 75/100

robjhyndman/forecast#1220 · Ouverte le 23/9/2026
Raise the minimum coro version once per-instance JIT recompilation is released Ouverte

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 65/100

JamesHWade/deputy#192 · Ouverte le 23/9/2026
`crps.numeric` does not pass `permutations` correctly to `crps.matrix` Ouverte

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 75/100

stan-dev/loo#397 · 1 réaction · Ouverte le 23/9/2026
[Bug]: Right-eyed flounder images display backwards Ouverte

bug triage_needed

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 75/100

nmfs-ost/asar#574 · Ouverte le 22/9/2026
Add `<thead>` and `<tbody>` tags into output of `as_html` Ouverte

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 72/100

pharmaverse/rtables#1123 · 1 commentaire · 1 réaction · Ouverte le 22/9/2026

Plus d'issues R