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Python · 10 estrellas
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Python · 1 estrella

Para principiantes Todo

Abierto Todos

UX: Fix skimage min_size deprecation warnings Abierto

chore

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

vanvalenlab/torch-mesmer#68 · Abierto el 17/9/2026
Unable ro login to deepcell login Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100

vanvalenlab/cellSAM#135 · Abierto el 15/9/2026
https://users.deepcell.org/ returns 503 Service Temporarily Unavailable Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

vanvalenlab/deepcell-types#57 · 4 comentarios · Abierto el 21/8/2026
Unable to access CellSAM v1.2 weights due to DeepCell account registration/login issue Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

vanvalenlab/cellSAM#134 · 1 comentario · Abierto el 16/8/2026
cannot log in the website to download the model Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/deepcell-types#56 · 2 comentarios · Abierto el 16/8/2026
Unable to receive activation/password reset email from users.deepcell.org Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

vanvalenlab/cellSAM#133 · 2 comentarios · Abierto el 22/7/2026
Deepcell Registration Issue Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

vanvalenlab/cellSAM#132 · Abierto el 10/6/2026
Registration unavailable: request for academic API token or offline model access Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/deepcell-tf#749 · 5 comentarios · 2 reacciones · Abierto el 14/5/2026
Unclear Training Data Provenance Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100

vanvalenlab/torch-mesmer#55 · Abierto el 7/5/2026
register via the DeepCell porta Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

vanvalenlab/cellSAM#127 · 1 comentario · Abierto el 5/5/2026
Inference performance degradation Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 42/100

vanvalenlab/torch-mesmer#52 · 2 comentarios · Abierto el 1/5/2026
Unable to access users.deepcell.org and online demo; request for official CellSAM model access for academic research Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/cellSAM#125 · 1 comentario · Abierto el 13/4/2026
I can't log in to the website https://users.deepcell.org/login/ with my email, and I can't download the pretrained model Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/cellSAM#124 · Abierto el 12/4/2026
I have completed the registration successfully, but I did not receive the verification email. Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

vanvalenlab/cellSAM#123 · Abierto el 26/3/2026
Unable to receive verification email after successful registration with `.edu.cn` address, and login always says username/password do not match Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/cellSAM#122 · Abierto el 15/3/2026
Registration request pending for 40+ days Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

vanvalenlab/cellSAM#121 · Abierto el 9/3/2026
Expanded TissueNet is Undocumented Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

vanvalenlab/cellSAM#120 · Abierto el 7/3/2026
Users Deepcell website is down Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/deepcell-tf#748 · 1 comentario · Abierto el 5/3/2026
Can't use cellSam because there's no way to get DEEPCELL_ACCESS_TOKEN Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

vanvalenlab/cellSAM#118 · 8 comentarios · 1 reacción · Abierto el 4/3/2026
Support for python>3.10 Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 42/100

vanvalenlab/deepcell-tf#747 · 2 comentarios · Abierto el 27/2/2026
channel_mapping.yaml Has Duplicate Rows Abierto

Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 55/100

vanvalenlab/deepcell-types#38 · Abierto el 25/2/2026
Masks Are Far Too Small Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

vanvalenlab/deepcell-tf#746 · Abierto el 18/2/2026
Dynamic relevant point calculations for flow following Abierto

fix

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/torch-mesmer#43 · Abierto el 10/2/2026
Compare post-processing approaches Abierto

question

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/torch-mesmer#41 · Abierto el 10/2/2026
Investigate 4-channel output Abierto

question

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/torch-mesmer#40 · Abierto el 10/2/2026
Conflicting Instructions Between Tutorial and Journal Article Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

vanvalenlab/deepcell-types#37 · Abierto el 6/2/2026
BnT Cells Unsupported Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/deepcell-types#36 · 1 comentario · Abierto el 5/2/2026
Service Unavailable: DeepCell.org/predict inaccessible and API key registration broken Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/deepcell-tf#745 · 6 comentarios · Abierto el 29/1/2026
Pre-trained model weights Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/cellSAM#116 · 4 comentarios · Abierto el 24/1/2026
Online CellSAM demo fails on official sample image Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

vanvalenlab/cellSAM#115 · 3 comentarios · Abierto el 20/1/2026
Stitching Causes Chopped Off Cells Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

vanvalenlab/cellSAM#113 · Abierto el 14/1/2026
iou_threshold Not Documented Below Function Prototype Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

vanvalenlab/cellSAM#112 · Abierto el 14/1/2026
Download Training Data Output Directory and Archive Size Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

vanvalenlab/cellSAM#111 · Abierto el 5/1/2026
Clarification on preprocess_kwargs and postprocess_kwargs parameters in Mesmer Abierto

enhancement

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 30/100

vanvalenlab/deepcell-tf#744 · Abierto el 19/12/2025
CellSAM Boundaries are Much Bigger than the Cells Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

vanvalenlab/cellSAM#104 · Abierto el 13/11/2025
2D labels contain nested instances (cell fully inside another) Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

vanvalenlab/cellSAM#103 · 2 comentarios · Abierto el 16/10/2025
Multi GPU support Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

vanvalenlab/cellSAM#102 · 1 comentario · Abierto el 15/10/2025
SeNNet deepcell types integration Senoquant Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/deepcell-types#34 · 2 comentarios · 1 reacción · Abierto el 8/10/2025
SpotDetection's postprocessing function does not support batched prediction Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 55/100

vanvalenlab/deepcell-spots#97 · Abierto el 17/9/2025
Pre-trained model weights - official release, version 1.2 Abierto

Models and Datasets

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/cellSAM#90 · 28 comentarios · 2 reacciones · Abierto el 12/9/2025
Deployment at cellsam.deepcell.org transition to new infrastructure Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/cellSAM#75 · 1 comentario · Abierto el 29/7/2025
Is This Preprocessing Pipeline Suitable for H&E-Stained RGB Input? Abierto

bug documentation

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/cellSAM#74 · 9 comentarios · Abierto el 21/7/2025
problems in registering to Deepcell Users Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

vanvalenlab/deepcell-tf#741 · 3 comentarios · 2 reacciones · Abierto el 5/7/2025
Isotope Spillover Abierto

question

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/deepcell-types#16 · 4 comentarios · Abierto el 8/6/2025
Data Download Hard-coded to Home Directory Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

vanvalenlab/deepcell-types#13 · 1 reacción · Abierto el 24/5/2025
Apply segmentation to H&E images Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/cellSAM#63 · 1 comentario · Abierto el 10/4/2025
Exporting to ONNX possible? Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vanvalenlab/cellSAM#62 · Abierto el 2/4/2025
Wholeslide segmentation performance issues Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

vanvalenlab/cellSAM#52 · Abierto el 17/3/2025
Can you release the code for constructing the consensus training dataset? Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

vanvalenlab/deepcell-spots#94 · 1 comentario · Abierto el 17/3/2025
DeepCell NuclearSegmentation no longer allows model=None kwarg Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

vanvalenlab/deepcell-spots#93 · 1 reacción · Abierto el 12/3/2025

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