Write docs/output.md
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Evaluación
- Dificultad
- 2/5
- Tiempo estimado
- 1-3 horas
- Aptitud para principiantes
- 78/100
- Tipo de issue
- Documentación
- Claridad
- Bien especificado
- Estado de actividad
- Activo
- Área
- documentation
Línea de trabajo
Empieza por el archivo vacío docs/output.md e inspecciona las carpetas de salida del pipeline, desde 01_ hasta 09_, para identificar su contenido. Céntrate en las tablas de 09_sample_summary y en los gráficos de QC y changepoint. Después, documenta cada salida y explica las etiquetas de essentiality y los valores de la matriz descritos en el issue. El trabajo estará terminado cuando docs/output.md describa claramente estas salidas.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Part of #5.
docs/output.md is an empty TODO. Describe each results folder (01_ to 09_) and the files in it, in particular the 09_sample_summary tables: the mapped/insertion/chromosome summaries (1_ to 3_) and the gene matrices 4_gene_insertion_counts.tsv, 5_gene_read_counts.tsv and 6_gene_essentiality.tsv (1 = essential, 0 = ambiguous or non-essential). Also explain the essentiality calls (essential / ambiguous / non-essential) and the QC and changepoint plots.
- Lenguaje dominante
- Nextflow
- Estrellas
- 0
- Forks
- 1
- Merge medio
- 10 h 36 min
- PR fusionados (30 d)
- 4
Preparar el entorno
Inicia el contenedor de desarrollo del proyecto en tu navegador, con tu propia cuenta de GitHub.
- Sin Dockerfile ni archivo de Docker Compose
- Tiene una plantilla de pull request
- Leer la guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
Más de nf-core/captnseq
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documentation
Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 68/100
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Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100
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Rewrite docs/usage.md for this pipelinePosiblemente ocupada @simonjeanneau la tomó hace 3 días. Abiertodocumentation
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Repair the fully parallelized/multi-thread modePosiblemente ocupada @simonjeanneau la tomó hace 4 días. Abiertoenhancement
Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100
Todos los issues de nf-core/captnseq
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