Write docs/output.md

Đang mở Phù hợp với người mới
#16 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
2/5
Thời gian dự kiến
1-3 giờ
Mức phù hợp với người mới
78/100
Loại issue
Tài liệu
Độ rõ ràng
Đặc tả rõ ràng
Mức độ hoạt động
Sôi nổi
Lĩnh vực
documentation

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu với tệp docs/output.md đang để trống và kiểm tra các thư mục đầu ra của pipeline từ 01_ đến 09_ để xác định nội dung của chúng. Tập trung vào các bảng trong 09_sample_summary và các biểu đồ QC cùng changepoint, sau đó ghi lại từng đầu ra và giải thích các nhãn essentiality cũng như giá trị ma trận được mô tả trong issue. Hoàn tất khi docs/output.md mô tả rõ các đầu ra này.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

documentation

Part of #5.

docs/output.md is an empty TODO. Describe each results folder (01_ to 09_) and the files in it, in particular the 09_sample_summary tables: the mapped/insertion/chromosome summaries (1_ to 3_) and the gene matrices 4_gene_insertion_counts.tsv, 5_gene_read_counts.tsv and 6_gene_essentiality.tsv (1 = essential, 0 = ambiguous or non-essential). Also explain the essentiality calls (essential / ambiguous / non-essential) and the QC and changepoint plots.

Ngôn ngữ chính
Nextflow
Star
0
Fork
1
Merge trung bình
10 giờ 36 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
4

Chuẩn bị môi trường

Mở trong Codespaces

Khởi chạy dev container của dự án ngay trên trình duyệt, bằng tài khoản GitHub của bạn.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của nf-core/captnseq

Tất cả issue của nf-core/captnseq

Issue tương tự

Thêm issue về Documentation

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.