DiG protein explanation
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Evaluación
- Dificultad
- 4/5
- Tiempo estimado
- 3-5 días
- Aptitud para principiantes
- 25/100
- Tipo de issue
- Documentación
- Claridad
- Necesita aclaración
- Estado de actividad
- Estancado
- Stack tecnológico
- python
Línea de trabajo
Revisa los seis ejemplos de proteínas DiG proporcionados y el flujo de trabajo que produce los archivos .npz init y final. Documenta cómo deben usar los usuarios esas salidas y cómo generar los archivos .pkl de entrada para un PDB que no esté en el conjunto de datos proporcionado; la tarea estará completa cuando un tutorial breve responda a ambas preguntas.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Hi team,
First of all thank you for making this wonderful program public. I was testing out the program today for the protein part of DiG and followed with 1 of the 6 provided examples. I have two questions:
- How to use the output: it has two .npz files one for init and one for final. What should I do with them.
- I want to use the program for a pdb that is not in the provided dataset. How would I go with generating the input .pkl files?
It would be really helpful for us biologists if you could give a short tutorial on how to use the program!
Please have a great week!
Best
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 2.5k
- Forks
- 374
- Merge medio
- 14 h 51 min
- PR fusionados (30 d)
- 3
Preparar el entorno
Aún no hemos revisado los archivos de configuración de este proyecto. Empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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