DiG protein explanation
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 25/100
- Tipo di issue
- Documentazione
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Ferma
- Stack tecnologico
- python
- Ambito
- documentation, machine-learning
Direzione di ricerca
Esamina i sei esempi di proteine DiG forniti e il workflow che produce i file .npz init e final. Documenta come gli utenti devono utilizzare questi output e come generare i file .pkl di input per un PDB esterno al dataset fornito; il completamento richiede che un breve tutorial risponda a entrambe le domande.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Hi team,
First of all thank you for making this wonderful program public. I was testing out the program today for the protein part of DiG and followed with 1 of the 6 provided examples. I have two questions:
- How to use the output: it has two .npz files one for init and one for final. What should I do with them.
- I want to use the program for a pdb that is not in the provided dataset. How would I go with generating the input .pkl files?
It would be really helpful for us biologists if you could give a short tutorial on how to use the program!
Please have a great week!
Best
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 2.5k
- Fork
- 374
- Merge medio
- 14h 51m
- PR unite (30g)
- 3
Preparare l'ambiente
Non abbiamo ancora controllato i file di configurazione di questo progetto. Parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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