DiG protein explanation
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 25/100
- Loại issue
- Tài liệu
- Độ rõ ràng
- Cần làm rõ
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Công nghệ
- python
- Lĩnh vực
- documentation, machine-learning
Hướng nghiên cứu
Xem xét sáu ví dụ protein DiG được cung cấp và workflow tạo ra các tệp .npz init và final. Tài liệu hóa cách người dùng nên sử dụng các đầu ra đó và cách tạo các tệp .pkl đầu vào cho một PDB nằm ngoài dataset được cung cấp; công việc được xem là hoàn thành khi một hướng dẫn ngắn trả lời cả hai câu hỏi.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
Hi team,
First of all thank you for making this wonderful program public. I was testing out the program today for the protein part of DiG and followed with 1 of the 6 provided examples. I have two questions:
- How to use the output: it has two .npz files one for init and one for final. What should I do with them.
- I want to use the program for a pdb that is not in the provided dataset. How would I go with generating the input .pkl files?
It would be really helpful for us biologists if you could give a short tutorial on how to use the program!
Please have a great week!
Best
- Ngôn ngữ chính
- Python
- Star
- 2.5k
- Fork
- 374
- Merge trung bình
- 14 giờ 51 phút
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 3
Chuẩn bị môi trường
Chúng tôi chưa kiểm tra các tệp thiết lập môi trường của dự án này. Hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của microsoft/Graphormer
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
microsoft/Graphormer#211 ·
-
SAS updataĐang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100
microsoft/Graphormer#210 ·
-
Interpolation between statesĐang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
microsoft/Graphormer#208 ·
-
CUDA out of memoryĐang mở
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 20/100
microsoft/Graphormer#207 · 1 bình luận ·
-
How do I prepare OC20 dataset?Đang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
microsoft/Graphormer#205 ·
Tất cả issue của microsoft/Graphormer
Issue tương tự
-
good first issue
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 88/100
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 88/100
vllm-project/vllm-metal#822 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
vector-store
Độ khó 1/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 90/100
mem0ai/mem0#7461 · 1 bình luận ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
[Bug]: chunk_span_bounds and _validated_chunk_spans reject Pydantic models ChunkSpan and AudioFileĐang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
BasedHardware/omi#19047 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 88/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày