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  • RPCA vs. rarefaction reference
    Offen

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100

    microbiome/OMA#911 ·

  • Multi-omics chapters
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    microbiome/OMA#909 · 4 Kommentare ·

  • tidyplots
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    microbiome/OMA#906 ·

  • Bioc book instructions
    Offen

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 35/100

    microbiome/OMA#867 ·

  • PERMANOVA final output table
    Offen

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100

    microbiome/OMA#863 ·

  • Data-leakage in ML examples
    Offen
    G2: AI

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 52/100

    microbiome/OMA#861 ·

  • Some code is too complex
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 52/100

    microbiome/OMA#859 ·

  • Two book versions now
    Evtl. wieder frei @0xMuluh hat das vor 119 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

    microbiome/OMA#856 · 6 Kommentare · 1 zugewiesene Person ·

  • Use of r2u Docker images to speed up image building
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    microbiome/OMA#845 · 1 Kommentar ·

  • GitHub Actions failure
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    microbiome/OMA#828 · 4 Kommentare ·

  • Improve rarefaction docs: move explanation earlier & show `niter` usage for alpha/beta diversity
    Offen
    documentation enhancement G4: adoption good first issue

    Schwierigkeit 2/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 82/100

    microbiome/OMA#823 ·

  • Association chapter
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    microbiome/OMA#815 ·

  • Chapter 18 overlap with network chapters
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    microbiome/OMA#814 · 3 Kommentare ·

  • mikropml update
    Offen
    G2: AI

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    microbiome/OMA#803 · 12 Kommentare ·

  • Docker - GenomeInfoDb
    Offen

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 45/100

    microbiome/OMA#790 ·

  • Enforce certain code styling across the book
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100

    microbiome/OMA#780 · 4 Kommentare ·

  • Transformation recommendations
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    microbiome/OMA#779 · 2 Kommentare ·

  • Time series chapters
    Offen

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 35/100

    microbiome/OMA#774 · 2 Kommentare ·

  • Inconsistent filenames in Docker image in relation to OMA book
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    microbiome/OMA#769 · 4 Kommentare ·

  • Diversity and taxonomy level + transformation
    Offen

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 55/100

    microbiome/OMA#767 · 2 Kommentare ·

  • migration of 'Tools-Microbiome-Analysis' web resource to OMA
    Evtl. wieder frei @TuomasBorman hat das vor 501 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
    documentation enhancement G4: adoption

    microbiome/OMA#756 · 2 Kommentare · 1 zugewiesene Person ·

  • ReducedExperiment
    Evtl. wieder frei @Sadia12345 hat das vor 16 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

    Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 55/100

    microbiome/OMA#748 · 2 Kommentare ·

  • Add a better example of agglomerateByVariable usage
    Offen

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 58/100

    microbiome/OMA#740 · 6 Kommentare ·

  • References to DAA chapter
    Evtl. wieder frei @0xMuluh hat das vor 570 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

    microbiome/OMA#687 · 5 Kommentare · 1 zugewiesene Person ·

  • Develop Carpentries tutorial?
    Offen
    G4: adoption

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    microbiome/OMA#650 ·

  • Ordination methods, interpretation
    Offen

    Schwierigkeit 2/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 45/100

    microbiome/OMA#511 · 3 Kommentare ·

  • Update Multi-omics chapter to use SE/TSE framework
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    microbiome/OMA#477 ·

  • QMP example data
    Evtl. wieder frei @ShadmanIshraq hat das vor 903 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

    microbiome/OMA#470 · 2 Kommentare · 2 zugewiesene Personen ·

  • Integrate new multiomic chapters in the book view
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

    microbiome/OMA#437 · 2 Kommentare ·

  • Use a different MAE data for more meaningful MOFA results
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    microbiome/OMA#321 · 1 Kommentar ·

  • Compare to OSCA & OSTA books
    Evtl. wieder frei @antagomir hat das vor 752 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

    microbiome/OMA#272 · 4 Kommentare · 1 zugewiesene Person ·

  • Nice table examples
    Evtl. wieder frei @0xMuluh hat das vor 752 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

    microbiome/OMA#250 · 1 zugewiesene Person ·

  • Relation between OMA tutorial and website?
    Evtl. wieder frei @TuomasBorman hat das vor 821 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

    microbiome/OMA#247 · 4 Kommentare · 2 zugewiesene Personen ·

  • Accessible color palettes as the recommended default for OMA
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100

    microbiome/OMA#197 · 1 Kommentar ·

  • neatmap / neatsort
    Evtl. wieder frei @0xMuluh hat das vor 821 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

    microbiome/OMA#146 · 25 Kommentare · 2 zugewiesene Personen ·

  • Heatmap tools in SEtools package
    Evtl. wieder frei @TuomasBorman hat das vor 1760 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

    microbiome/OMA#127 · 5 Kommentare · 2 zugewiesene Personen ·

  • batch effects
    Evtl. wieder frei @antagomir hat das vor 1938 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

    microbiome/OMA#13 · 3 Kommentare · 1 zugewiesene Person ·

  • IntegratedLearner chapter uses the removed `IntegratedLearnerFromMAE()`
    Evtl. vergeben @0xMuluh hat das vor 21 Tagen übernommen. Offen

    microbiome/OMA#902 · 1 zugewiesene Person ·

  • Clarification for ML data preprocessing
    Evtl. vergeben @0xMuluh hat das vor 65 Tagen übernommen. Offen
    G2: AI

    Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 35/100

    microbiome/OMA#860 ·

  • Confusion/Error on filtering out zero-variance features
    Evtl. vergeben @0xMuluh hat das vor 65 Tagen übernommen. Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100

    microbiome/OMA#822 ·

  • Clarification for IntegratedLearner preprocessing
    Evtl. vergeben @0xMuluh hat das vor 65 Tagen übernommen. Offen
    G2: AI

    Schwierigkeit 1/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 35/100

    microbiome/OMA#817 ·

  • Citations to open data resources
    Evtl. vergeben @raivo-otus hat das vor 394 Tagen übernommen. Offen

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 28/100

    microbiome/OMA#816 · 2 Kommentare · 1 Reaktion ·

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