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  • RPCA vs. rarefaction reference
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 68/100

    microbiome/OMA#911 ·

  • Multi-omics chapters
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 35/100

    microbiome/OMA#909 · 4 comentários ·

  • tidyplots
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

    microbiome/OMA#906 ·

  • Bioc book instructions
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 35/100

    microbiome/OMA#867 ·

  • PERMANOVA final output table
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 68/100

    microbiome/OMA#863 ·

  • Data-leakage in ML examples
    Aberta
    • Algo errado?
    G2: AI

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 52/100

    microbiome/OMA#861 ·

  • Some code is too complex
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 52/100

    microbiome/OMA#859 ·

  • Two book versions now
    Talvez livre de novo Aberta
    • Algo errado?

    microbiome/OMA#856 · 6 comentários · 1 responsável ·

  • Use of r2u Docker images to speed up image building
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 55/100

    microbiome/OMA#845 · 1 comentário ·

  • GitHub Actions failure
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    microbiome/OMA#828 · 4 comentários ·

  • Improve rarefaction docs: move explanation earlier & show `niter` usage for alpha/beta diversity
    Aberta
    • Algo errado?
    documentation enhancement G4: adoption good first issue

    Dificuldade 2/5 Meio dia Facilidade para iniciantes 82/100

    microbiome/OMA#823 ·

  • Association chapter
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    microbiome/OMA#815 ·

  • Chapter 18 overlap with network chapters
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    microbiome/OMA#814 · 3 comentários ·

  • mikropml update
    Aberta
    • Algo errado?
    G2: AI

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

    microbiome/OMA#803 · 12 comentários ·

  • Docker - GenomeInfoDb
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 45/100

    microbiome/OMA#790 ·

  • Enforce certain code styling across the book
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 42/100

    microbiome/OMA#780 · 4 comentários ·

  • Transformation recommendations
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

    microbiome/OMA#779 · 2 comentários ·

  • Time series chapters
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 35/100

    microbiome/OMA#774 · 2 comentários ·

  • Inconsistent filenames in Docker image in relation to OMA book
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 48/100

    microbiome/OMA#769 · 4 comentários ·

  • Diversity and taxonomy level + transformation
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 55/100

    microbiome/OMA#767 · 2 comentários ·

  • migration of 'Tools-Microbiome-Analysis' web resource to OMA
    Talvez livre de novo Aberta
    • Algo errado?
    documentation enhancement G4: adoption

    microbiome/OMA#756 · 2 comentários · 1 responsável ·

  • ReducedExperiment
    Talvez livre de novo Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 55/100

    microbiome/OMA#748 · 2 comentários ·

  • Add a better example of agglomerateByVariable usage
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 58/100

    microbiome/OMA#740 · 6 comentários ·

  • References to DAA chapter
    Talvez livre de novo Aberta
    • Algo errado?

    microbiome/OMA#687 · 5 comentários · 1 responsável ·

  • Develop Carpentries tutorial?
    Aberta
    • Algo errado?
    G4: adoption

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    microbiome/OMA#650 ·

  • Ordination methods, interpretation
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 2/5 Meio dia Facilidade para iniciantes 45/100

    microbiome/OMA#511 · 3 comentários ·

  • Update Multi-omics chapter to use SE/TSE framework
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    microbiome/OMA#477 ·

  • QMP example data
    Talvez livre de novo Aberta
    • Algo errado?

    microbiome/OMA#470 · 2 comentários · 2 responsáveis ·

  • Integrate new multiomic chapters in the book view
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    microbiome/OMA#437 · 2 comentários ·

  • Use a different MAE data for more meaningful MOFA results
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    microbiome/OMA#321 · 1 comentário ·

  • Compare to OSCA & OSTA books
    Talvez livre de novo Aberta
    • Algo errado?

    microbiome/OMA#272 · 4 comentários · 1 responsável ·

  • Nice table examples
    Talvez livre de novo Aberta
    • Algo errado?

    microbiome/OMA#250 · 1 responsável ·

  • Relation between OMA tutorial and website?
    Talvez livre de novo Aberta
    • Algo errado?

    microbiome/OMA#247 · 4 comentários · 2 responsáveis ·

  • Accessible color palettes as the recommended default for OMA
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 42/100

    microbiome/OMA#197 · 1 comentário ·

  • neatmap / neatsort
    Talvez livre de novo Aberta
    • Algo errado?

    microbiome/OMA#146 · 25 comentários · 2 responsáveis ·

  • Heatmap tools in SEtools package
    Talvez livre de novo Aberta
    • Algo errado?

    microbiome/OMA#127 · 5 comentários · 2 responsáveis ·

  • batch effects
    Talvez livre de novo Aberta
    • Algo errado?

    microbiome/OMA#13 · 3 comentários · 1 responsável ·

  • IntegratedLearner chapter uses the removed `IntegratedLearnerFromMAE()`
    Talvez já em andamento Aberta
    • Algo errado?

    microbiome/OMA#902 · 1 responsável ·

  • Clarification for ML data preprocessing
    Talvez já em andamento Aberta
    • Algo errado?
    G2: AI

    Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 35/100

    microbiome/OMA#860 ·

  • Confusion/Error on filtering out zero-variance features
    Talvez já em andamento Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 42/100

    microbiome/OMA#822 ·

  • Clarification for IntegratedLearner preprocessing
    Talvez já em andamento Aberta
    • Algo errado?
    G2: AI

    Dificuldade 1/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 35/100

    microbiome/OMA#817 ·

  • Citations to open data resources
    Talvez já em andamento Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 28/100

    microbiome/OMA#816 · 2 comentários · 1 reação ·

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