Hacktoberfest 2026 : les issues que les mainteneurs ont marquées pour octobre, ouvertes et accessibles aux débutants. Parcourir les issues Hacktoberfest

cytomining/DeepProfiler

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Morphological profiling using deep learning

cytomining/DeepProfiler est-il accessible aux débutants ?

Nous avons vu trop peu de pull requests récentes de contributeurs externes sur cytomining/DeepProfiler pour dire à quelle fréquence elles sont fusionnées. Aucune issue accessible aux débutants n'est ouverte pour l'instant ; la liste ci-dessous montre les autres issues que nous avons pour ce dépôt.

Étoiles
129
Forks
52
Issues débutants ouvertes
0
Issues indexées
25
Merge moyen
5 h 20 min
PR mergées (30 j)
2
Langage dominant
Python
Licence
BSD-3-Clause
Dernier push GitHub
2/9/2026
Dernière indexation
15/9/2026
Guide de contribution
Code de conduite
Labels débutants
help wanted

Comment contribuer à cytomining/DeepProfiler

  1. Lisez d'abord le guide de contribution : il explique comment les mainteneurs veulent que les changements soient proposés, testés et relus.
  2. Lisez son code de conduite : il s'applique aux issues et aux pull requests autant qu'au chat.
  3. Vos contributions seront publiées sous la licence BSD-3-Clause du projet.
  4. Suivez le dépôt pour savoir quand une nouvelle issue accessible aux débutants s'ouvre, ou parcourez les autres issues ci-dessous.
Accessible aux débutants Tout
Ouverte Toutes

Les issues sur lesquelles quelqu’un travaille peut-être déjà sont listées en dernier. Tout trier par date

  • Request of clarifications about processed data in `cpg0019`
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    cytomining/DeepProfiler#360 · 5 commentaires ·

  • ValueError: Unexpectedly found an instance of type `<class 'keras.src.engine.keras_tensor.KerasTensor'>`. Expected a symbolic tensor instance.
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    cytomining/DeepProfiler#359 ·

  • DeepProfiler produces incorrect crops if provided with images of different sizes
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 25/100

    cytomining/DeepProfiler#355 · 1 commentaire ·

  • What's your thoughts on plate/batch-wise whitening for batch effect?
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    cytomining/DeepProfiler#352 · 3 commentaires ·

  • finetune the model you provided error
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    cytomining/DeepProfiler#347 · 3 commentaires ·

  • Speed up profiling
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

    cytomining/DeepProfiler#325 ·

  • Image names for full image crop generator are taken as is
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 45/100

    cytomining/DeepProfiler#322 ·

  • Merge metadata and outlines.
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 42/100

    cytomining/DeepProfiler#318 ·

  • Finalize transition to TFv2
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

    cytomining/DeepProfiler#317 · 4 commentaires ·

  • Old / unwanted commands?
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    cytomining/DeepProfiler#316 · 2 commentaires ·

  • Save location files in nested folder structures as well
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    cytomining/DeepProfiler#315 · 1 commentaire ·

  • Port individual channel crop generator.
    Peut-être à nouveau libre Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    cytomining/DeepProfiler#313 · 1 personne assignée ·

  • TFv2 training time issue
    Peut-être à nouveau libre Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    bug enhancement

    cytomining/DeepProfiler#310 · 1 personne assignée ·

  • Port single image crop generator and profiling to TFv2
    Peut-être à nouveau libre Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    cytomining/DeepProfiler#309 · 1 personne assignée ·

  • Integrate online labels crop generator into traintf2
    Peut-être à nouveau libre Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    cytomining/DeepProfiler#308 · 1 personne assignée ·

  • Resume single cells export
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

    cytomining/DeepProfiler#296 ·

  • Update the wiki
    Peut-être à nouveau libre Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    cytomining/DeepProfiler#289 · 3 commentaires · 1 personne assignée ·

  • Parameterize augmentations
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

    cytomining/DeepProfiler#281 · 2 commentaires ·

  • Build helper functions
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

    cytomining/DeepProfiler#262 · 1 commentaire ·

  • Reading Location files gives unhelpful error
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 38/100

    cytomining/DeepProfiler#261 · 3 commentaires ·

  • Check coordinates of the boxes during cropping.
    Peut-être à nouveau libre Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    bug enhancement

    cytomining/DeepProfiler#258 · 1 réaction · 1 personne assignée ·

  • Document how to setup ec2 instance in AWS to run DeepProfiler
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    help wanted question

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    cytomining/DeepProfiler#257 · 2 commentaires · 1 réaction ·

  • Performance metrics - report average class accuracy, rather than just accuracy.
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 38/100

    cytomining/DeepProfiler#239 ·

  • Cropping doesn't support multiple targets
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 15/100

    cytomining/DeepProfiler#136 · 1 commentaire ·

  • Parameterize the use of pixel normalization
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 42/100

    cytomining/DeepProfiler#25 ·

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