`libhdf5` not defined for `juliacall` `0.9.25` on M1 runner when using python built with openssl 1.x
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Evaluación
- Dificultad
- 4/5
- Tiempo estimado
- 3-5 días
- Aptitud para principiantes
- 35/100
- Tipo de issue
- Error
- Claridad
- Bastante claro
- Estado de actividad
- Estancado
- Stack tecnológico
- python
- Área
- build-system
Línea de trabajo
Comienza con el repositorio mínimo y la ejecución de GitHub Actions enlazada en el issue, y después compara los cambios de dependencias entre juliacall 0.9.24 y 0.9.25, especialmente el cambio de OpenSSL_jll. Reproduce la precompilación de HDF5 en el runner macOS M1 y en Ubuntu, y considera terminado el issue cuando ambos entornos funcionen sin fijación específica de plataforma.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Affects: JuliaCall
Describe the bug
Since 0.9.25 precompilation of HDF5 fails (only) on macos-latest M1 GitHub runner.
Here's an issue where we identified it:
https://github.com/JuliaIO/HDF5.jl/issues/1198
And here's a minimal repository reproducing it:
https://github.com/mtsokol/hdf5-bug
https://github.com/mtsokol/hdf5-bug/actions/runs/15098780219/job/42436980940
Pinning juliacall version to 0.9.24 fixes it:
https://github.com/mtsokol/hdf5-bug/pull/1
Additional context
Looking at the 0.9.25 diff my guess would be that it has something to do with OpenSLL_jll change.
Additionally, I reported 3 weeks ago: https://github.com/JuliaPackaging/Yggdrasil/issues/11077 which was HDF5 dependency juliapkg issue.
I had to pin juliacall only for macos-latest, as pinning it for all environments caused ubuntu-latest to fail with OpenSLL_jll dependency error.
- Lenguaje dominante
- Julia
- Estrellas
- 1.1k
- Forks
- 89
- Merge medio
- 2 d 15 h
- PR fusionados (30 d)
- 7
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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