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issue using sctk package for geom2trace function

Offen
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Dieses Issue hat noch niemand übernommen.

Bewertung

Schwierigkeit
5/5
Geschätzter Aufwand
Über eine Woche
Anfängerfreundlichkeit
25/100
Issue-Typ
Feature
Klarheit
Muss geklärt werden
Aktivitätsstatus
Veraltet
Tech-Stack
plotly, r

Rechercherichtung

Beginnen Sie damit, die SCTK-UMAP-Visualisierung zu reproduzieren, die im neuesten Docker-Image geom2trace.default und die Warnung geom_GeomTextRepel auslöst. Der Payload nennt keine Quelldateien oder Tests, suchen Sie daher zuerst die Implementierung von geom2trace und die vorhandenen geom-Handler. Als erledigt gilt dies, wenn dieses geom ohne die gemeldete Warnung unterstützt wird.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Beschreibung

While executing SCTK pipeline (using the newest docker image, see : https://sctk.bu.edu/app/SingleCellTK), I encountered following issue trying to plot different UMAP visualizations.

UMAP Complete
Warning in geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomTextRepel() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at

I would like to ask if this functionality can be considered for next update of the software?

Vorherrschende Sprache
R
Sterne
2.7k
Forks
641
PR-Merge-Kennzahlen
Keine gemergten PRs in 30 T.

Beitragsleitfaden

Beitragsleitfaden öffnen

Erste Schritte

  1. Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
  4. Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

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