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issue using sctk package for geom2trace function

Ouverte
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Évaluation

Difficulté
5/5
Temps estimé
Plus d'une semaine
Accessibilité débutants
25/100
Type d'issue
Fonctionnalité
Clarté
À clarifier
Activité
À l'abandon
Stack technique
plotly, r
Domaine
data-visualization

Piste de recherche

Commencez par reproduire la visualisation UMAP de SCTK qui déclenche geom2trace.default et l’avertissement geom_GeomTextRepel dans la dernière image Docker. Le payload ne nomme aucun fichier source ni aucun test ; localisez donc d’abord l’implémentation de geom2trace et les gestionnaires geom existants. Le travail est terminé lorsque ce geom est pris en charge sans l’avertissement signalé.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

While executing SCTK pipeline (using the newest docker image, see : https://sctk.bu.edu/app/SingleCellTK), I encountered following issue trying to plot different UMAP visualizations.

UMAP Complete
Warning in geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomTextRepel() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at

I would like to ask if this functionality can be considered for next update of the software?

Langage dominant
R
Étoiles
2.7k
Forks
641
Aucune PR mergée en 30 j

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