issue using sctk package for geom2trace function

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#2,332 建立於 2024年1月14日 0 則留言 0 個 reaction 已指派 0 人在 GitHub 檢視

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評估

難度: 5/5
預估耗時: 一週以上
新手友好度: 25/100

Issue 類型: 功能
描述清晰度: 需要釐清
活躍度: 停滯
技術堆疊: plotly, r
領域: data-visualization

研究方向

首先，在最新的 Docker 映像中重現會觸發 geom2trace.default 和 geom_GeomTextRepel 警告的 SCTK UMAP 視覺化。payload 未指明原始檔案或測試，因此先定位 geom2trace 的實作和現有的 geom 處理器；當此 geom 在沒有所回報警告的情況下受到支援時，即表示完成。

由索引模型根據 Issue 內容生成。

描述

While executing SCTK pipeline (using the newest docker image, see : https://sctk.bu.edu/app/SingleCellTK), I encountered following issue trying to plot different UMAP visualizations.

UMAP Complete
Warning in geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomTextRepel() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at

I would like to ask if this functionality can be considered for next update of the software?

主要語言: R
星號: 2.7k
分支: 641
PR 合併指標: 30 天內沒有已合併 PR

貢獻指南

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