Hacktoberfest 2026: die Issues, die Maintainer für den Oktober markiert haben – offen und einsteigerfreundlich. Hacktoberfest-Issues durchsuchen

nf-core/seqsubmit

Zum Folgen anmelden Auf GitHub ansehen

nf-core pipeline for data submission to ENA

Ist nf-core/seqsubmit einsteigerfreundlich?

In den letzten 30 Tagen hat nf-core/seqsubmit 6 von 10 Pull Requests von externen Beitragenden gemergt, und die Maintainer antworten meist binnen 1 Tag. Gerade ist kein einsteigerfreundliches Issue offen; die Liste unten zeigt die übrigen Issues, die wir von diesem Repository kennen.

Sterne
22
Forks
11
Offene Anfänger-Issues
0
Indexierte Issues
25
Ø Merge
1 T. 4 Std.
Gemergte PRs (30 T.)
8
Vorherrschende Sprache
Nextflow
Lizenz
MIT
Letzter GitHub-Push
08.10.2026
Zuletzt indexiert
19.9.2026
Beitragsleitfaden
Verhaltenskodex
Anfänger-Labels
Keine Anfänger-Labels indexiert

So tragen Sie zu nf-core/seqsubmit bei

  1. Lesen Sie zuerst den Contributing Guide: Er beschreibt, wie die Maintainer Änderungen vorgeschlagen, getestet und geprüft haben möchten.
  2. Das Projekt bringt einen Dev Container mit: Öffnen Sie es in Codespaces, und Sie haben eine lauffähige Umgebung im Browser.
  3. Lesen Sie den Verhaltenskodex: Er gilt für Issues und Pull Requests ebenso wie für den Chat.
  4. Folgen Sie dem Repository, um von neuen einsteigerfreundlichen Issues zu erfahren, oder sehen Sie sich die übrigen Issues unten an.
Einsteigerfreundlich Alles
Offen Alle

Issues, an denen vielleicht schon jemand arbeitet, stehen am Ende. Alles nach Datum anzeigen

  • --webincli_mode validate will include study and co assembly sample regsitration
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    bug

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    nf-core/seqsubmit#118 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • MultiQC skips assembly metadata table for co-assemblies (comma in quoted Runs field)
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    bug

    Schwierigkeit 3/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 70/100

    nf-core/seqsubmit#115 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Refactoring of FIND_CONCATENATE usage: replace with collectFile() operator
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    nf-core/seqsubmit#97 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Support submission of MAGs/bins generated from co-assemblies
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement genome_submit

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 68/100

    nf-core/seqsubmit#96 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Non-mandatory feilds support
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100

    nf-core/seqsubmit#89 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Submission of a MAG/bin without submitting the assembly or raw reads
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

    nf-core/seqsubmit#87 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Add tests for --is_private flag for different kinds of data
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    nf-core/seqsubmit#80 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Add READS assigned_accessions table into multiqc.report
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement read_submit

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 68/100

    nf-core/seqsubmit#70 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Add ENA_VALIDATE_CREDENTIALS module
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    nf-core/seqsubmit#65 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Add viral sequence submission support
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 52/100

    nf-core/seqsubmit#63 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Improve --centre_name and --upload_tpa arguments usage
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    assembly_submit enhancement genome_submit

    nf-core/seqsubmit#57 · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Implement chunking
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    nf-core/seqsubmit#55 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Add human contamination removal optional step
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    nf-core/seqsubmit#51 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Accept assembly submissions for raw-reads not submitted to ENA
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    assembly_submit enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    nf-core/seqsubmit#29 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Write a nf-core/mag samplesheet generator for nf-core/seqsubmit
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    nf-core/seqsubmit#6 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Write nf-test for ena-webin-cli
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    nf-core/seqsubmit#5 · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Long-read end-to-end submission
    Evtl. vergeben Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    nf-core/seqsubmit#110 · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Allow single contig genomes to be submitted as chromosomes for long-reads
    Evtl. vergeben Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    nf-core/seqsubmit#109 · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Allow BAM as input for long-reads submission
    Evtl. vergeben Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 42/100

    nf-core/seqsubmit#98 · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Support submission of metagenomic assemblies generated from co-assemblies
    Evtl. vergeben Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    assembly_submit enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    nf-core/seqsubmit#61 · 1 Kommentar · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Add eukaryotic MAGs/bins support
    Evtl. vergeben Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement eukaryotes

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    nf-core/seqsubmit#40 · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

Neue Issues direkt in Ihr Postfach

Eine kurze Übersicht über anfängerfreundliche GitHub-Issues.