SpikeInterface

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• Cannot load previously-loadable Open Ephys Neuropixels 2 data (XML file issue)

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  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 58/100

  SpikeInterface/probeinterface#469 · 2 Kommentare · Erstellt am 16.9.2026

• GatherToNpy/Zarr could pre-allocate stores when number of spike is known

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  performance

  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4787 · Erstellt am 16.9.2026

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• Support pobes whose geometry is chosen at order time

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

  SpikeInterface/probeinterface_library#81 · Erstellt am 15.9.2026

• Lets keep in mind that changing the spike dtype could break the numba kernel

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  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4781 · 1 Kommentar · Erstellt am 15.9.2026

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• DartSort: optimize strategy to retrieve `main_channel_id` from sorting

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  performance sorters

  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4777 · Erstellt am 14.9.2026

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• Extend postprocessing/metrics extensions tests for `SortingAnalyzer` with no units

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  testing

  Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4756 · Erstellt am 03.9.2026

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• probe plotting feature request

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  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 68/100

  SpikeInterface/probeinterface#465 · Erstellt am 31.8.2026

• bad channel detection `psd_hf_threshold` units documentation

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  Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 74/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4745 · Erstellt am 28.8.2026

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• Training a curation model with metrics from older version fail

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  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4742 · 1 Kommentar · Erstellt am 27.8.2026

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• Bad channel detection: widget for manual threshold determination

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  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4738 · Erstellt am 25.8.2026

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• Cleaning up units?

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  curation question

  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4726 · 2 Kommentare · Erstellt am 31.7.2026

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• Add shank thickness to definition

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  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 62/100

  SpikeInterface/probeinterface_library#73 · 5 Kommentare · Erstellt am 30.7.2026

• Overview (HD-)MEA's in terms of density

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4722 · Erstellt am 30.7.2026

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• Tracking: Efficient Lazy/Chronic Computations in SortingAnalyzer

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  chronic performance

  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4719 · Erstellt am 28.7.2026

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• Add `slidingRP` optional dependency

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  dependencies discussion metrics

  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4704 · 1 Kommentar · Erstellt am 21.7.2026

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• Sorting simple queries should not force full data reading

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4702 · 1 Reaktion · Erstellt am 20.7.2026

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• `Sortinganalyzer.select_channels()`: update select_channel_extension_data for waveforms/PCA

  Offen

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  core

  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 58/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4700 · Erstellt am 20.7.2026

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• NWBSortingExtractor: pre-populate `_cached_lexsorted_spike_vector` when building spike vector

  Evtl. wieder frei @h-mayorquin hat das vor 72 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

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  extractors performance

  SpikeInterface/spikeinterface#4698 · 2 zugewiesene Personen · Erstellt am 17.7.2026

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• Rename `MockRecording` to `SimpleNoiseRecording` and handle : gain + pregenerated/on_the_fly.

  Evtl. wieder frei @h-mayorquin hat das vor 72 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

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  core

  SpikeInterface/spikeinterface#4697 · 1 zugewiesene Person · Erstellt am 17.7.2026

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• Question: Is possible/reasonable to include "select_peaks" to run_node_pipeline?

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  question

  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4694 · 3 Kommentare · Erstellt am 17.7.2026

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• Sorters should set `main_channel_id` property, when available

  Evtl. wieder frei @chrishalcrow hat das vor 75 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

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  core

  SpikeInterface/spikeinterface#4692 · 1 zugewiesene Person · Erstellt am 14.7.2026

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• CambridgeNeurotech ASSY-325D H10 & E-1 probes inconsistent with documentation

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  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

  SpikeInterface/probeinterface_library#67 · 1 Kommentar · Erstellt am 11.7.2026

• What should `to_reordered_spike_vector` do?

  Offen

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4683 · 4 Kommentare · Erstellt am 10.7.2026

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• Move `sortingcomponents` out of `spikeinterface`

  Offen

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  discussion

  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4669 · 5 Kommentare · Erstellt am 09.7.2026

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• export_to_phy vs using kilosort sorter output params.py directly

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  exporters

  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4635 · 2 Kommentare · Erstellt am 01.7.2026

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• Template metrics seems to assume negative polarity, causing incorrect "peak_to_trough_duration" and "halfwidth" for positive units

  Offen

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  metrics question

  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4634 · 6 Kommentare · Erstellt am 01.7.2026

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• Add shank thickness to the Probe model

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 48/100

  SpikeInterface/probeinterface#452 · 1 Kommentar · Erstellt am 24.6.2026

• Extracting recording from multiwell

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  NEO

  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4625 · 6 Kommentare · Erstellt am 24.6.2026

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• Recordings with 'impossible' neuron positions

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

  SpikeInterface/MEArec#188 · Erstellt am 23.6.2026

• Rec group set to shank_id in NP 2.0 multishank, but to probe_id for NP 1.0

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  question

  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

  SpikeInterface/probeinterface#449 · 7 Kommentare · Erstellt am 19.6.2026

• Slice Probe and ProbeGroup by stable identifiers, not positional integers

  Offen

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100

  SpikeInterface/probeinterface#447 · 2 Kommentare · 1 Reaktion · Erstellt am 13.6.2026

• Proposal: Add anti-aliasing option to decimate()

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  preprocessing

  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4605 · 2 Kommentare · Erstellt am 02.6.2026

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• Iterative Isosplit doesn't work with SpykingCircus2

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  sorters

  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 68/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4604 · Erstellt am 02.6.2026

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• Question about LFP scaling and units in export_to_ibl_gui()

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  exporters

  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4603 · 1 Kommentar · Erstellt am 02.6.2026

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• State of Neuropixels support in SpikeGadgets/Trodes

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  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

  SpikeInterface/probeinterface#444 · Erstellt am 22.5.2026

• `read_spikegadgets_neuropixels` applies a display offset to multi-probe geometry; should it?

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  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

  SpikeInterface/probeinterface#442 · Erstellt am 22.5.2026

• Clarify scope of `valid_unit_periods` extension and the `periods` argument in metric extensions

  Offen

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4590 · 1 Kommentar · Erstellt am 20.5.2026

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• Aligning waveforms across spike clusters/templates

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  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4582 · 1 Kommentar · Erstellt am 15.5.2026

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• correlograms with swapped indices are not mirrored versions of each other

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  SpikeInterface/spikeinterface#4576 · 1 Kommentar · Erstellt am 07.5.2026

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• docker, kilosort4, blackwell

  Evtl. wieder frei @alejoe91 hat das vor 139 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen

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  SpikeInterface/spikeinterface-dockerfiles#91 · 1 zugewiesene Person · Erstellt am 28.4.2026

• Creating a sparse analyzer with multiprocessing crashes if sorting has a lot of units

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  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4566 · 2 Kommentare · Erstellt am 27.4.2026

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• Feature Request: Making order = np.argsort(device_channel_indices) optional

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  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 52/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4565 · 11 Kommentare · Erstellt am 25.4.2026

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• combine_probes lose 'device_channel_indices'

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  SpikeInterface/probeinterface#431 · 1 Kommentar · Erstellt am 25.4.2026

• Very large difference in sorting using SC2 vs Lupin with dense recordings

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  SpikeInterface/spikeinterface#4561 · 3 Kommentare · Erstellt am 23.4.2026

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• `aggregate_channels` does not re-index per-channel identifier columns

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  bug

  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 50/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4546 · 1 Kommentar · Erstellt am 21.4.2026

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• `ProbeGroup` should enforce contact position uniqueness across probes

  Offen

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  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 56/100

  SpikeInterface/probeinterface#422 · Erstellt am 17.4.2026

• Remove the strategy argument from the noise generators

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  SpikeInterface/spikeinterface#4522 · 2 Kommentare · 1 Reaktion · Erstellt am 16.4.2026

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• Copy recording on `register_recording` to avoid shared mutation

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  SpikeInterface/spikeinterface#4519 · 2 Kommentare · Erstellt am 16.4.2026

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• Lupin clustering distant spikes

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  question

  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4517 · 4 Kommentare · Erstellt am 15.4.2026

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• Make `num_channels` available on `BaseRecordingSegment`

  Offen

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  enhancement

  Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 72/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4510 · 2 Kommentare · Erstellt am 14.4.2026

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