SpikeInterface

Issues em que talvez alguém já esteja trabalhando aparecem no fim. Ordenar tudo por data

• Remove `segment_index` from the spike vector(s)

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  Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 32/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4816 · Aberta em 2/10/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Cannot load previously-loadable Open Ephys Neuropixels 2 data (XML file issue)

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  Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 58/100

  SpikeInterface/probeinterface#469 · 2 comentários · Aberta em 16/9/2026

• Support pobes whose geometry is chosen at order time

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  Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 35/100

  SpikeInterface/probeinterface_library#81 · Aberta em 15/9/2026

• Lets keep in mind that changing the spike dtype could break the numba kernel

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  Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 30/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4781 · 1 comentário · Aberta em 15/9/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• DartSort: optimize strategy to retrieve `main_channel_id` from sorting

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  performance sorters

  Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 30/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4777 · Aberta em 14/9/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Extend postprocessing/metrics extensions tests for `SortingAnalyzer` with no units

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  testing

  Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 68/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4756 · Aberta em 3/9/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Add function to `estimate_templates_from_recording`

  Talvez livre de novo @yger assumiu há 33 dias e não há nenhum pull request aberto. Aberta

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  sorters

  SpikeInterface/spikeinterface#4747 · 2 responsáveis · Aberta em 31/8/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• probe plotting feature request

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  Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 68/100

  SpikeInterface/probeinterface#465 · Aberta em 31/8/2026

• Training a curation model with metrics from older version fail

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  curation

  Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 55/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4742 · 1 comentário · Aberta em 27/8/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Bad channel detection: widget for manual threshold determination

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  widgets

  Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 55/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4738 · Aberta em 25/8/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Cleaning up units?

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  curation question

  Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4726 · 2 comentários · Aberta em 31/7/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Add shank thickness to definition

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  Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 62/100

  SpikeInterface/probeinterface_library#73 · 5 comentários · Aberta em 30/7/2026

• Overview (HD-)MEA's in terms of density

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  question

  Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 30/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4722 · 1 comentário · Aberta em 30/7/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Tracking: Efficient Lazy/Chronic Computations in SortingAnalyzer

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  chronic performance

  Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4719 · Aberta em 28/7/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Add `slidingRP` optional dependency

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  dependencies discussion metrics

  Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4704 · 1 comentário · Aberta em 21/7/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Sorting simple queries should not force full data reading

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  Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 35/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4702 · 1 reação · Aberta em 20/7/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• NWBSortingExtractor: pre-populate `_cached_lexsorted_spike_vector` when building spike vector

  Talvez livre de novo @h-mayorquin assumiu há 78 dias e não há nenhum pull request aberto. Aberta

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  extractors performance

  SpikeInterface/spikeinterface#4698 · 2 responsáveis · Aberta em 17/7/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Rename `MockRecording` to `SimpleNoiseRecording` and handle : gain + pregenerated/on_the_fly.

  Talvez livre de novo @h-mayorquin assumiu há 78 dias e não há nenhum pull request aberto. Aberta

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  core

  SpikeInterface/spikeinterface#4697 · 1 responsável · Aberta em 17/7/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Question: Is possible/reasonable to include "select_peaks" to run_node_pipeline?

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  question

  Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 42/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4694 · 3 comentários · Aberta em 17/7/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• CambridgeNeurotech ASSY-325D H10 & E-1 probes inconsistent with documentation

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  Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

  SpikeInterface/probeinterface_library#67 · 1 comentário · Aberta em 11/7/2026

• What should `to_reordered_spike_vector` do?

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  SpikeInterface/spikeinterface#4683 · 4 comentários · Aberta em 10/7/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Move `sortingcomponents` out of `spikeinterface`

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  discussion

  Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 35/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4669 · 5 comentários · Aberta em 9/7/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• export_to_phy vs using kilosort sorter output params.py directly

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  exporters

  Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4635 · 2 comentários · Aberta em 1/7/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Template metrics seems to assume negative polarity, causing incorrect "peak_to_trough_duration" and "halfwidth" for positive units

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  metrics question

  Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 48/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4634 · 6 comentários · Aberta em 1/7/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Add shank thickness to the Probe model

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  SpikeInterface/probeinterface#452 · 1 comentário · Aberta em 24/6/2026

• Extracting recording from multiwell

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  NEO

  Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 38/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4625 · 6 comentários · Aberta em 24/6/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Recordings with 'impossible' neuron positions

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  SpikeInterface/MEArec#188 · Aberta em 23/6/2026

• Rec group set to shank_id in NP 2.0 multishank, but to probe_id for NP 1.0

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  Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

  SpikeInterface/probeinterface#449 · 7 comentários · Aberta em 19/6/2026

• Slice Probe and ProbeGroup by stable identifiers, not positional integers

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  SpikeInterface/probeinterface#447 · 2 comentários · 1 reação · Aberta em 13/6/2026

• Iterative Isosplit doesn't work with SpykingCircus2

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  Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 68/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4604 · Aberta em 2/6/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Question about LFP scaling and units in export_to_ibl_gui()

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  Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 42/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4603 · 1 comentário · Aberta em 2/6/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• State of Neuropixels support in SpikeGadgets/Trodes

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  SpikeInterface/probeinterface#444 · Aberta em 22/5/2026

• `read_spikegadgets_neuropixels` applies a display offset to multi-probe geometry; should it?

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  SpikeInterface/probeinterface#442 · Aberta em 22/5/2026

• Clarify scope of `valid_unit_periods` extension and the `periods` argument in metric extensions

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  SpikeInterface/spikeinterface#4590 · 1 comentário · Aberta em 20/5/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Aligning waveforms across spike clusters/templates

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  SpikeInterface/spikeinterface#4582 · 1 comentário · Aberta em 15/5/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• correlograms with swapped indices are not mirrored versions of each other

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  SpikeInterface/spikeinterface#4576 · 1 comentário · Aberta em 7/5/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• docker, kilosort4, blackwell

  Talvez livre de novo @alejoe91 assumiu há 145 dias e não há nenhum pull request aberto. Aberta

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  SpikeInterface/spikeinterface-dockerfiles#91 · 1 responsável · Aberta em 28/4/2026

• Creating a sparse analyzer with multiprocessing crashes if sorting has a lot of units

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  SpikeInterface/spikeinterface#4566 · 2 comentários · Aberta em 27/4/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Feature Request: Making order = np.argsort(device_channel_indices) optional

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  SpikeInterface/spikeinterface#4565 · 11 comentários · Aberta em 25/4/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• combine_probes lose 'device_channel_indices'

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  SpikeInterface/probeinterface#431 · 1 comentário · Aberta em 25/4/2026

• Very large difference in sorting using SC2 vs Lupin with dense recordings

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  SpikeInterface/spikeinterface#4561 · 3 comentários · Aberta em 23/4/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• `aggregate_channels` does not re-index per-channel identifier columns

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  bug

  Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 50/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4546 · 1 comentário · Aberta em 21/4/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• `ProbeGroup` should enforce contact position uniqueness across probes

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  Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 56/100

  SpikeInterface/probeinterface#422 · Aberta em 17/4/2026

• Remove the strategy argument from the noise generators

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  SpikeInterface/spikeinterface#4522 · 2 comentários · 1 reação · Aberta em 16/4/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Copy recording on `register_recording` to avoid shared mutation

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  SpikeInterface/spikeinterface#4519 · 2 comentários · Aberta em 16/4/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Lupin clustering distant spikes

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  question

  Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4517 · 4 comentários · Aberta em 15/4/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Make `num_channels` available on `BaseRecordingSegment`

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  enhancement

  Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 72/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4510 · 2 comentários · Aberta em 14/4/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Delete a failed SortingAnalyzer extension

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  core postprocessing

  Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 48/100

  SpikeInterface/spikeinterface#4507 · 1 comentário · 1 reação · Aberta em 10/4/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• applying curaiton fails if all units were either split or deleted

  Talvez livre de novo @chrishalcrow assumiu há 176 dias e não há nenhum pull request aberto. Aberta

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  bug curation

  SpikeInterface/spikeinterface#4501 · 2 comentários · 1 responsável · Aberta em 9/4/2026

  Mantenedores costumam responder em até 1 dia

• Add docs on curation customization (callback)

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  Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 35/100

  SpikeInterface/spikeinterface-gui#262 · Aberta em 8/4/2026