DiamondLightSource/python-murfey

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Client-Server architecture hauling Cryo-EM data around systems

Sterne: 2
Forks: 1
Offene Anfänger-Issues: 0
Indexierte Issues: 34
Ø Merge: 1 T. 12 Std.
Gemergte PRs (30 T.): 22

Vorherrschende Sprache: Python
Lizenz: BSD-3-Clause
Letzter GitHub-Push: 18.9.2026
Zuletzt indexiert: 15.9.2026
Beitragsleitfaden: Kein Beitragsleitfaden
Verhaltenskodex: Kein Verhaltenskodex
Anfänger-Labels: Keine Anfänger-Labels indexiert

Einsteigerfreundlich Alles

Offen Alle

Bisher 34 offene Issues indexiert

Restructure the data collection group tags to use the rsyncer table Offen

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

DiamondLightSource/python-murfey#792 · Erstellt am 30.4.2026
Rsyncers don't start correctly on reconnect Offen

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

DiamondLightSource/python-murfey#791 · Erstellt am 29.4.2026
CrYOLO model path caching means changes are not detected during collection Offen

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#646 · Erstellt am 05.8.2025
Add server-side endpoints to handle processing of XRM files Offen

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

DiamondLightSource/python-murfey#630 · Erstellt am 14.7.2025
Add database tables to store XRM workflow metadata as needed Offen

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100

DiamondLightSource/python-murfey#629 · Erstellt am 14.7.2025
Add analyser and context logic for XRM workflow Offen

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100

DiamondLightSource/python-murfey#628 · Erstellt am 14.7.2025
Add logic to automate XRM data transfer and processing workflow Offen

client enhancement server xrm

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100

DiamondLightSource/python-murfey#627 · Erstellt am 14.7.2025
Spaces in file paths still cause problems Offen

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

DiamondLightSource/python-murfey#619 · Erstellt am 03.7.2025
API endpoints in "murfey.server.api.spa" might be vestigial and can be removed Offen

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 28/100

DiamondLightSource/python-murfey#596 · 1 Kommentar · Erstellt am 21.5.2025
The cleanup function doesn't fully wipe the database of entries related to that particular session Offen

bug server

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

DiamondLightSource/python-murfey#581 · 1 Kommentar · Erstellt am 15.4.2025
Cleaner rsync still submits messages to server Offen

bug client

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 40/100

DiamondLightSource/python-murfey#580 · Erstellt am 15.4.2025
The "allow_removal" MachineConfig key doesn't work Offen

client

DiamondLightSource/python-murfey#562 · 1 zugewiesene Person · Erstellt am 08.4.2025
No logic to handle case where no microscope image is provided for the frontend Offen

bug server web ui

Schwierigkeit 2/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 45/100

DiamondLightSource/python-murfey#551 · Erstellt am 31.3.2025
Finalising all rsyncers through the instrument server seems to cause connection issues with the database Offen

bug web ui

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#530 · 1 Kommentar · Erstellt am 21.3.2025
Add MachineConfig key to set whether and how permissions are modified when transferring files via rsync Offen

enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#489 · 1 zugewiesene Person · Erstellt am 12.2.2025
Murfey validates ALL MachineConfigs in the MachineConfig file Offen

bug server

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

DiamondLightSource/python-murfey#488 · Erstellt am 12.2.2025
RSync URL for instrument server setup Offen

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

DiamondLightSource/python-murfey#474 · Erstellt am 30.1.2025
Murfey server still looks for security configuration file path from environment variable instead of machine configuration Offen

bug server

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#397 · 2 Kommentare · Erstellt am 06.11.2024
Refactor SQL tables, API endpoints, and feedback-callback function into submodules Offen

enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#375 · 1 zugewiesene Person · Erstellt am 18.10.2024
Handle instrument server post failures Offen

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#348 · Erstellt am 27.9.2024
Remove the tilt offset parameter for tomography Offen

Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#347 · Erstellt am 26.9.2024
Murfey for CryoCLEM Offen

cryo-clem enhancement

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 10/100

DiamondLightSource/python-murfey#288 · Erstellt am 23.5.2024
Coordination of different rsync threads Offen

DiamondLightSource/python-murfey#251 · 1 zugewiesene Person · Erstellt am 09.4.2024
When destinations are explicitly added for existing sources they should be created Offen

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#236 · Erstellt am 22.3.2024
Develop unit tests for API endpoints Offen

DiamondLightSource/python-murfey#235 · 1 zugewiesene Person · Erstellt am 22.3.2024
Record position tracking data in ISPyB tables Offen

position tracking

DiamondLightSource/python-murfey#234 · 1 zugewiesene Person · Erstellt am 21.3.2024
Better handling of ISPyB lookup of session ID failure needed Offen

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 20/100

DiamondLightSource/python-murfey#229 · Erstellt am 11.3.2024
Record dose for each movie as measured during acquisition Offen

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

DiamondLightSource/python-murfey#213 · Erstellt am 24.1.2024
Add option to disable alertmanager monitoring Offen

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#200 · Erstellt am 13.12.2023
Register processing parameters to provide users with more detail Offen

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

DiamondLightSource/python-murfey#199 · Erstellt am 13.12.2023
Add more tests for server side Offen

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 20/100

DiamondLightSource/python-murfey#195 · Erstellt am 08.12.2023
Configurable processing and processing parameters Offen

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

DiamondLightSource/python-murfey#151 · Erstellt am 28.3.2023
Show pixel size in Angstroms Offen

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

DiamondLightSource/python-murfey#111 · Erstellt am 14.11.2022
Add a time API call to get current server time Offen

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

DiamondLightSource/python-murfey#56 · Erstellt am 14.4.2022

DiamondLightSource/python-murfey

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