DiamondLightSource/python-murfey

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Client-Server architecture hauling Cryo-EM data around systems

Étoiles: 2
Forks: 1
Issues débutants ouvertes: 0
Issues indexées: 34
Merge moyen: 1 j 12 h
PR mergées (30 j): 22

Langage dominant: Python
Licence: BSD-3-Clause
Dernier push GitHub: 18/9/2026
Dernière indexation: 15/9/2026
Guide de contribution: Aucun guide de contribution
Code de conduite: Aucun code de conduite
Labels débutants: Aucun label débutant indexé

Accessible aux débutants Tout

Ouverte Toutes

34 issues ouvertes indexées

Restructure the data collection group tags to use the rsyncer table Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

DiamondLightSource/python-murfey#792 · Ouverte le 30/4/2026
Rsyncers don't start correctly on reconnect Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 48/100

DiamondLightSource/python-murfey#791 · Ouverte le 29/4/2026
CrYOLO model path caching means changes are not detected during collection Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#646 · Ouverte le 5/8/2025
Add server-side endpoints to handle processing of XRM files Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

DiamondLightSource/python-murfey#630 · Ouverte le 14/7/2025
Add database tables to store XRM workflow metadata as needed Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 15/100

DiamondLightSource/python-murfey#629 · Ouverte le 14/7/2025
Add analyser and context logic for XRM workflow Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 15/100

DiamondLightSource/python-murfey#628 · Ouverte le 14/7/2025
Add logic to automate XRM data transfer and processing workflow Ouverte

client enhancement server xrm

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 15/100

DiamondLightSource/python-murfey#627 · Ouverte le 14/7/2025
Spaces in file paths still cause problems Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100

DiamondLightSource/python-murfey#619 · Ouverte le 3/7/2025
API endpoints in "murfey.server.api.spa" might be vestigial and can be removed Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 28/100

DiamondLightSource/python-murfey#596 · 1 commentaire · Ouverte le 21/5/2025
The cleanup function doesn't fully wipe the database of entries related to that particular session Ouverte

bug server

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

DiamondLightSource/python-murfey#581 · 1 commentaire · Ouverte le 15/4/2025
Cleaner rsync still submits messages to server Ouverte

bug client

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 40/100

DiamondLightSource/python-murfey#580 · Ouverte le 15/4/2025
The "allow_removal" MachineConfig key doesn't work Ouverte

client

DiamondLightSource/python-murfey#562 · 1 personne assignée · Ouverte le 8/4/2025
No logic to handle case where no microscope image is provided for the frontend Ouverte

bug server web ui

Difficulté 2/5 Une demi-journée Accessibilité débutants 45/100

DiamondLightSource/python-murfey#551 · Ouverte le 31/3/2025
Finalising all rsyncers through the instrument server seems to cause connection issues with the database Ouverte

bug web ui

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#530 · 1 commentaire · Ouverte le 21/3/2025
Add MachineConfig key to set whether and how permissions are modified when transferring files via rsync Ouverte

enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#489 · 1 personne assignée · Ouverte le 12/2/2025
Murfey validates ALL MachineConfigs in the MachineConfig file Ouverte

bug server

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 48/100

DiamondLightSource/python-murfey#488 · Ouverte le 12/2/2025
RSync URL for instrument server setup Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

DiamondLightSource/python-murfey#474 · Ouverte le 30/1/2025
Murfey server still looks for security configuration file path from environment variable instead of machine configuration Ouverte

bug server

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#397 · 2 commentaires · Ouverte le 6/11/2024
Refactor SQL tables, API endpoints, and feedback-callback function into submodules Ouverte

enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#375 · 1 personne assignée · Ouverte le 18/10/2024
Handle instrument server post failures Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#348 · Ouverte le 27/9/2024
Remove the tilt offset parameter for tomography Ouverte

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#347 · Ouverte le 26/9/2024
Murfey for CryoCLEM Ouverte

cryo-clem enhancement

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 10/100

DiamondLightSource/python-murfey#288 · Ouverte le 23/5/2024
Coordination of different rsync threads Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#251 · 1 personne assignée · Ouverte le 9/4/2024
When destinations are explicitly added for existing sources they should be created Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#236 · Ouverte le 22/3/2024
Develop unit tests for API endpoints Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#235 · 1 personne assignée · Ouverte le 22/3/2024
Record position tracking data in ISPyB tables Ouverte

position tracking

DiamondLightSource/python-murfey#234 · 1 personne assignée · Ouverte le 21/3/2024
Better handling of ISPyB lookup of session ID failure needed Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 20/100

DiamondLightSource/python-murfey#229 · Ouverte le 11/3/2024
Record dose for each movie as measured during acquisition Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 30/100

DiamondLightSource/python-murfey#213 · Ouverte le 24/1/2024
Add option to disable alertmanager monitoring Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

DiamondLightSource/python-murfey#200 · Ouverte le 13/12/2023
Register processing parameters to provide users with more detail Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

DiamondLightSource/python-murfey#199 · Ouverte le 13/12/2023
Add more tests for server side Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 20/100

DiamondLightSource/python-murfey#195 · Ouverte le 8/12/2023
Configurable processing and processing parameters Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

DiamondLightSource/python-murfey#151 · Ouverte le 28/3/2023
Show pixel size in Angstroms Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 25/100

DiamondLightSource/python-murfey#111 · Ouverte le 14/11/2022
Add a time API call to get current server time Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 38/100

DiamondLightSource/python-murfey#56 · Ouverte le 14/4/2022

DiamondLightSource/python-murfey

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