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CDCgov
73 indexierte Repositories · Auf GitHub ansehen
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phoenix
🔥🐦🔥PHoeNIx: a platform agnostic pipeline for healthcare-associated and antimicrobial resistant pathogens
Python · 112 Sterne
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cdc-open-viz
CDC OpenViz is a library of React packages for data visualization.
TypeScript · 55 Sterne
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wastewater-informed-covid-forecasting
Wastewater-informed COVID-19 forecasting models submitted to the COVID-19 Forecast Hub
R · 51 Sterne
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template
Template repository with rules, practices, and privacy, license, records notices to help people use the CDCgov GitHub organization.
41 Sterne
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Rust · 36 Sterne
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ww-inference-model
An in-development R package and a Bayesian hierarchical model jointly fitting multiple "local" wastewater data streams and "global" case ...
R · 33 Sterne
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irma
IRMA (the Iterative Refinement Meta-Assembler) is a highly configurable and adaptive tool for virus genome assembly.
Perl · 29 Sterne
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PyRenew
Python package for multi-signal Bayesian renewal modeling with JAX and NumPyro.
Python · 29 Sterne
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covid19-forecast-hub
A repository run by the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) to collect forecasts of incident respiratory COVID-19 hospital a...
29 Sterne
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Mira
MIRA: Portable, Interactive Application for High-Quality Influenza, SARS-CoV-2 and RSV Genome Assembly, Annotation, and Curation
Python · 25 Sterne
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Julia · 23 Sterne
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Nextflow · 22 Sterne
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dibbs-query-connector
A FHIR client allowing public health agencies to query health care organizations directly or via a TEFCA QHIN
PLpgSQL · 18 Sterne
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cfa-stf-routine-forecasting
Models and infrastructure for routine forecasting of respiratory disease burden
Python · 17 Sterne
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Rnssp-rmd-templates
Rnssp R Markdown templates are custom-built, parameterized R Markdown templates with seamless integration to the Rnssp R package to enhan...
R · 14 Sterne
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dibbs-ecr-viewer
DIBBS eCR Viewer
HTML · 14 Sterne
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prime-fhir-converter
The CDC’s Pandemic-Ready Interoperability Modernization Effort (PRIME) Java based FHIR conversion library
Kotlin · 14 Sterne
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DynODE
CDC/CFA/Predict/Scenarios ODE Modeling Framework
Python · 13 Sterne
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R · 13 Sterne
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Rnssp-shiny-apps
Rnssp Shiny Apps are custom-built applications with seamless integration to the Rnssp R package.
R · 12 Sterne
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Issues, an denen vielleicht schon jemand arbeitet, stehen am Ende. Alles nach Datum anzeigen
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Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 72/100
CDCgov/cfa-vap-hm#46 ·
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Parquet asset type?Offen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 68/100
CDCgov/forecasttools#270 ·
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
CDCgov/AlgebraicEpiModels#11 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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dibbs-ecr-refiner
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
CDCgov/dibbs-ecr-refiner#1851 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#91 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#90 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#89 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 68/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#88 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#87 · 1 Kommentar ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#86 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#84 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#82 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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plz install wasm?Offen
Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 70/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#81 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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designs needed needs design review streamline eCR user request
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 68/100
CDCgov/dibbs-ecr-viewer#1782 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 72/100
CDCgov/AlgebraicEpiModels#10 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Filter by Program AreaOffenfeature streamline eCR user request
Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100
CDCgov/dibbs-ecr-viewer#1781 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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streamline eCR
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
CDCgov/dibbs-ecr-viewer#1780 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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streamline eCR
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100
CDCgov/dibbs-ecr-viewer#1779 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 55/100
CDCgov/wastewater-informed-covid-forecasting#393 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100
CDCgov/wastewater-informed-covid-forecasting#392 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 86/100
CDCgov/dibbs-ecr-diff#139 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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bug
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100
CDCgov/cfa-cloudops#297 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 45/100
CDCgov/cfa-stf-data#40 · 1 Kommentar ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
CDCgov/cfa-stf-data#39 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100
CDCgov/cfa-dataops#180 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
CDCgov/wastewater-informed-covid-forecasting#386 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
CDCgov/wastewater-informed-covid-forecasting#385 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Add public NSSP dataOffen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100
CDCgov/cfa-stf-data#38 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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🐛 bug FHIR conversion required
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 88/100
CDCgov/dibbs-ecr-viewer#1778 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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🐛 bug FHIR conversion required
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 76/100
CDCgov/dibbs-ecr-viewer#1777 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Demo posit workbenchOffen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
CDCgov/dibbs-ecr-diff#137 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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Improve efficiency: separate version discovery from data access and reuse the result of discoveryOffen
Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
CDCgov/cfa-dataops#179 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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dibbs-ecr-refiner Ready to Estimate
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 68/100
CDCgov/dibbs-ecr-refiner#1838 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100
CDCgov/cfa-vap-hm#34 ·
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
CDCgov/sirfunctions#486 ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
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Support time-varying ascertainment on the shared model axisEvtl. wieder frei @developer-rpai hat das vor 17 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offenmodel pyrenew
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 68/100
CDCgov/PyRenew#890 · 2 Kommentare ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 3 Tagen
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 58/100
CDCgov/cfa-stf-routine-forecasting#1327 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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CDCgov/cfa-cloudops#291 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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Epic
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
CDCgov/cfa-cloudops#290 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100
CDCgov/covid19-forecast-hub#1876 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
CDCgov/cfa-stf-routine-forecasting#1315 · 3 Kommentare ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
CDCgov/cfa-stf-routine-forecasting#1314 · 1 Kommentar ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Low Severity Bug: Universal
Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100
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Better error reportingOffen
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100
CDCgov/cfa-simulator#94 ·
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 66/100
CDCgov/cfa-simulator#93 ·
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
CDCgov/cfa-simulator#92 ·
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 35/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#79 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 2 Tagen
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