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CDCgov
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phoenix
🔥🐦🔥PHoeNIx: a platform agnostic pipeline for healthcare-associated and antimicrobial resistant pathogens
Python · 112 étoiles
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cdc-open-viz
CDC OpenViz is a library of React packages for data visualization.
TypeScript · 55 étoiles
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wastewater-informed-covid-forecasting
Wastewater-informed COVID-19 forecasting models submitted to the COVID-19 Forecast Hub
R · 51 étoiles
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template
Template repository with rules, practices, and privacy, license, records notices to help people use the CDCgov GitHub organization.
41 étoiles
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Rust · 36 étoiles
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ww-inference-model
An in-development R package and a Bayesian hierarchical model jointly fitting multiple "local" wastewater data streams and "global" case ...
R · 33 étoiles
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irma
IRMA (the Iterative Refinement Meta-Assembler) is a highly configurable and adaptive tool for virus genome assembly.
Perl · 29 étoiles
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PyRenew
Python package for multi-signal Bayesian renewal modeling with JAX and NumPyro.
Python · 29 étoiles
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covid19-forecast-hub
A repository run by the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) to collect forecasts of incident respiratory COVID-19 hospital a...
29 étoiles
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Mira
MIRA: Portable, Interactive Application for High-Quality Influenza, SARS-CoV-2 and RSV Genome Assembly, Annotation, and Curation
Python · 25 étoiles
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Julia · 23 étoiles
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Nextflow · 22 étoiles
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dibbs-query-connector
A FHIR client allowing public health agencies to query health care organizations directly or via a TEFCA QHIN
PLpgSQL · 18 étoiles
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cfa-stf-routine-forecasting
Models and infrastructure for routine forecasting of respiratory disease burden
Python · 17 étoiles
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Rnssp-rmd-templates
Rnssp R Markdown templates are custom-built, parameterized R Markdown templates with seamless integration to the Rnssp R package to enhan...
R · 14 étoiles
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dibbs-ecr-viewer
DIBBS eCR Viewer
HTML · 14 étoiles
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prime-fhir-converter
The CDC’s Pandemic-Ready Interoperability Modernization Effort (PRIME) Java based FHIR conversion library
Kotlin · 14 étoiles
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DynODE
CDC/CFA/Predict/Scenarios ODE Modeling Framework
Python · 13 étoiles
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R · 13 étoiles
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Rnssp-shiny-apps
Rnssp Shiny Apps are custom-built applications with seamless integration to the Rnssp R package.
R · 12 étoiles
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Les issues sur lesquelles quelqu’un travaille peut-être déjà sont listées en dernier. Tout trier par date
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model
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 55/100
CDCgov/PyRenew#901 · 7 commentaires ·
Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours
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Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 47/100
CDCgov/cfa-dagster#169 ·
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Parquet asset type?Ouverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100
Les mainteneurs répondent en général sous 2 jours
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Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 68/100
CDCgov/forecasttools#270 ·
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Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
CDCgov/AlgebraicEpiModels#11 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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dibbs-ecr-refiner
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100
CDCgov/dibbs-ecr-refiner#1851 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#91 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 5 jours
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Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 68/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#90 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 5 jours
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Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#89 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 5 jours
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Difficulté 1/5 Moins d'une heure Accessibilité débutants 68/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#88 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 5 jours
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Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#87 · 1 commentaire ·
Les mainteneurs répondent en général sous 5 jours
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Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#86 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 5 jours
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Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 68/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#84 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 5 jours
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Severities should all be slidersOuverte
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 68/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#82 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 5 jours
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plz install wasm?Ouverte
Difficulté 1/5 Moins d'une heure Accessibilité débutants 70/100
CDCgov/cfa-flu-simulator#81 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 5 jours
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designs needed needs design review streamline eCR user request
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 68/100
CDCgov/dibbs-ecr-viewer#1782 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 72/100
CDCgov/AlgebraicEpiModels#10 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Filter by Program AreaOuvertefeature streamline eCR user request
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 30/100
CDCgov/dibbs-ecr-viewer#1781 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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streamline eCR
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
CDCgov/dibbs-ecr-viewer#1780 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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streamline eCR
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100
CDCgov/dibbs-ecr-viewer#1779 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Consider a more informative error when all extrema are `NA` in `extract_diagnostic_extrema()`Ouverte
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 55/100
CDCgov/wastewater-informed-covid-forecasting#393 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 42/100
CDCgov/wastewater-informed-covid-forecasting#392 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Text edited after a matched inline element is not reported (`_node_updated` ignores `.tail`)Ouverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 86/100
CDCgov/dibbs-ecr-diff#139 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours
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bug
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 55/100
CDCgov/cfa-cloudops#297 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours
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Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 45/100
CDCgov/cfa-stf-data#40 · 1 commentaire ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100
CDCgov/cfa-stf-data#39 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 48/100
CDCgov/cfa-dataops#180 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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migrate to v5 `epidatr` APIOuverte
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
CDCgov/wastewater-informed-covid-forecasting#386 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100
CDCgov/wastewater-informed-covid-forecasting#385 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Add public NSSP dataOuverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100
CDCgov/cfa-stf-data#38 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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🐛 bug FHIR conversion required
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 88/100
CDCgov/dibbs-ecr-viewer#1778 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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🐛 bug FHIR conversion required
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 76/100
CDCgov/dibbs-ecr-viewer#1777 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Demo posit workbenchOuverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 15/100
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Convert add/delete to updateOuverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100
CDCgov/dibbs-ecr-diff#137 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours
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Improve efficiency: separate version discovery from data access and reuse the result of discoveryOuverte
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100
CDCgov/cfa-dataops#179 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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dibbs-ecr-refiner Ready to Estimate
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 68/100
CDCgov/dibbs-ecr-refiner#1838 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 30/100
CDCgov/cfa-vap-hm#34 ·
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Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
CDCgov/sirfunctions#486 ·
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Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
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Support time-varying ascertainment on the shared model axisPeut-être à nouveau libre @developer-rpai l’a pris il y a 18 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouvertemodel pyrenew
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 68/100
CDCgov/PyRenew#890 · 2 commentaires ·
Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours
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Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 58/100
CDCgov/cfa-stf-routine-forecasting#1327 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Add Metrics Script to CodebaseOuverte
CDCgov/cfa-cloudops#291 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours
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Epic
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100
CDCgov/cfa-cloudops#290 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours
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Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 30/100
CDCgov/covid19-forecast-hub#1876 ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100
CDCgov/cfa-stf-routine-forecasting#1315 · 3 commentaires ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100
CDCgov/cfa-stf-routine-forecasting#1314 · 1 commentaire ·
Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour
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negative control auto-QC "pass"OuverteLow Severity Bug: Universal
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 38/100
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Better error reportingOuverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 48/100
CDCgov/cfa-simulator#94 ·
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Watch backend files and rebuildOuverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 66/100
CDCgov/cfa-simulator#93 ·
Affichage des 100 plus récents
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