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AlexsLemonade
38 indexierte Repositories · Auf GitHub ansehen
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refinebio
Refine.bio harmonizes petabytes of publicly available biological data into ready-to-use datasets for cancer researchers and AI/ML scienti...
Python · 135 Sterne
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training-modules
A collection of modules that are combined into 1-5 day workshops on computational topics for the childhood cancer research community.
HTML · 80 Sterne
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scpca-nf
scpca-nf is the Nextflow workflow for processing Single-cell Pediatric Cancer Atlas Portal data
R · 20 Sterne
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OpenScPCA-analysis
An open, collaborative project to analyze data from the Single-cell Pediatric Cancer Atlas (ScPCA) Portal
HTML · 16 Sterne
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refinebio-examples
Example workflows for refine.bio data
HTML · 11 Sterne
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refinebio-frontend
Frontend app for refine.bio
JavaScript · 7 Sterne
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exrcise
Selectively Excise Code Chunks for Exercises
R · 4 Sterne
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scpca-portal
Single-cell Pediatric Cancer Atlas Portal is a growing database of uniformly processed single-cell data from pediatric cancer tumors and ...
JavaScript · 4 Sterne
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cranlock
Lock our R dependencies to specific versions.
Python · 2 Sterne
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ScPCAr
An R package for interacting with the ScPCA Portal API
R · 2 Sterne
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OpenScPCA-nf
A workflow for running OpenScPCA analysis modules
R · 2 Sterne
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refinebio-design
Design files and resources for refine.bio
Python · 1 Stern
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scRNA-seq_sandbox
Exploring some scRNA-seq methodologies, not a full-fledged pipeline ready for use
R · 1 Stern
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refinebio-docs
User Documentation for refine.bio
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fancySVD
Only the IterativeSVD algorithm from iskandr/fancyimpute to make dependency resolution easier.
Python · 1 Stern
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refinebio-py
A python client for the refine.bio API.
Python · 1 Stern
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Python · 1 Stern
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refinebio-web
Refinebio Web
JavaScript · 1 Stern
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R · 1 Stern
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reproducible-research
Repository for Reproducible Research Practices Training Workshop
HTML · 1 Stern
- 18 weitere Repositories liegen auf Auf GitHub ansehen
Issues, an denen vielleicht schon jemand arbeitet, stehen am Ende. Alles nach Datum anzeigen
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100
AlexsLemonade/morphport#95 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Add Event ModelOffenAPI
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100
AlexsLemonade/scpca-portal#2128 ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
AlexsLemonade/morphport#88 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Epic
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100
AlexsLemonade/morphport#87 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Epic
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
AlexsLemonade/scpca-portal#2125 ·
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Epic
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100
AlexsLemonade/scpca-portal#2124 ·
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Epic
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
AlexsLemonade/scpca-portal#2123 ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 28/100
AlexsLemonade/metafactory#44 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 38/100
AlexsLemonade/morphport#83 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
AlexsLemonade/morphport#78 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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release
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
AlexsLemonade/scpca-docs#519 ·
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Schwierigkeit 3/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 22/100
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
AlexsLemonade/training-modules#1115 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 1/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 65/100
AlexsLemonade/training-modules#1112 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Add sync_aggregations Tests for Project and SampleEvtl. wieder frei @avrohomgottlieb hat das vor 28 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#2117 · 1 zugewiesene Person ·
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Add sync_metadata Tests for Project, Sample and LibraryEvtl. wieder frei @avrohomgottlieb hat das vor 28 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#2115 · 1 zugewiesene Person ·
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release
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100
AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1437 ·
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CCDI node: the File entity as a CCDLDatasetEvtl. wieder frei @davidsmejia hat das vor 33 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#2111 · 1 zugewiesene Person ·
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CCDI node: Subject endpoints, and summary for Subject and SampleEvtl. wieder frei @davidsmejia hat das vor 33 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#2110 · 1 zugewiesene Person ·
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CCDI node: return the error bodies the spec definesEvtl. wieder frei @davidsmejia hat das vor 33 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#2109 · 1 zugewiesene Person ·
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OpenScPCA admin spelling
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 72/100
AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1434 ·
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Merge Recent Updates to Dev into feature/loadable-resourceEvtl. wieder frei @avrohomgottlieb hat das vor 49 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#2100 · 1 Kommentar · 1 zugewiesene Person ·
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Stand up CCDI mapping for dynamic responsesEvtl. wieder frei @davidsmejia hat das vor 62 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#2090 · 1 zugewiesene Person ·
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Compare Outputs of Feature Dev Stack and Staging Data LoadingEvtl. wieder frei @avrohomgottlieb hat das vor 63 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#2087 · 1 zugewiesene Person ·
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CCDI node: implement the static, config-driven endpointsEvtl. wieder frei @davidsmejia hat das vor 76 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#2072 · 1 zugewiesene Person ·
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CCDI node: vendor & pin the v1.3.0 spec, generate types, serve node OpenAPIEvtl. wieder frei @davidsmejia hat das vor 76 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#2071 · 1 zugewiesene Person ·
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CCDI node: scaffold the sequestered module behind a dark-by-default toggleEvtl. wieder frei @davidsmejia hat das vor 76 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#2070 · 1 zugewiesene Person ·
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 72/100
AlexsLemonade/scpca-nf#1332 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Update container definitions to use nf-core 4.1 config filesEvtl. wieder frei @jashapiro hat das vor 87 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/morphport#64 · 1 zugewiesene Person ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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API
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100
AlexsLemonade/scpca-portal#2063 ·
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analysis
AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1424 · 1 Kommentar ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
AlexsLemonade/scpca-nf#1325 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100
AlexsLemonade/morphport#57 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Epic
Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100
AlexsLemonade/morphport#56 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Remove legacy code in loadable-resource feature branchEvtl. wieder frei @avrohomgottlieb hat das vor 105 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#2048 · 1 zugewiesene Person ·
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Epic
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100
AlexsLemonade/morphport#53 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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science
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
AlexsLemonade/morphport#47 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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analysis
AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1414 ·
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analysis
AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1413 · 1 Kommentar ·
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 74/100
AlexsLemonade/ScPCAr#55 · 1 Kommentar ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
AlexsLemonade/morphport#43 · 1 Kommentar ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Epic
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
AlexsLemonade/scpca-portal#2001 ·
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Epic
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
AlexsLemonade/scpca-portal#2000 ·
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 70/100
AlexsLemonade/training-modules#1016 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Swap size -> linewidthOffen
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 72/100
AlexsLemonade/training-modules#1015 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Epic science
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100
AlexsLemonade/morphport#40 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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RFC: Upgrade Elasticsearch to OpenSearch 3.xEvtl. wieder frei @davidsmejia hat das vor 147 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/refinebio#3597 · 1 zugewiesene Person ·
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Epic
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100
AlexsLemonade/refinebio#3595 ·
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Add Mypy Type Hinting to Serializers and ViewsEvtl. wieder frei @avrohomgottlieb hat das vor 147 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
AlexsLemonade/scpca-portal#1994 · 1 zugewiesene Person ·
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Modernize InfrastructureOffenEpic
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100
AlexsLemonade/refinebio#3594 ·
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