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AlexsLemonade
36 repository indicizzati · Vedi su GitHub
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refinebio
Refine.bio harmonizes petabytes of publicly available biological data into ready-to-use datasets for cancer researchers and AI/ML scienti...
Python · 135 stelle
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training-modules
A collection of modules that are combined into 1-5 day workshops on computational topics for the childhood cancer research community.
HTML · 78 stelle
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scpca-nf
scpca-nf is the Nextflow workflow for processing Single-cell Pediatric Cancer Atlas Portal data
R · 19 stelle
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OpenScPCA-analysis
An open, collaborative project to analyze data from the Single-cell Pediatric Cancer Atlas (ScPCA) Portal
HTML · 16 stelle
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refinebio-examples
Example workflows for refine.bio data
HTML · 11 stelle
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refinebio-frontend
Frontend app for refine.bio
JavaScript · 7 stelle
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exrcise
Selectively Excise Code Chunks for Exercises
R · 4 stelle
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scpca-portal
Single-cell Pediatric Cancer Atlas Portal is a growing database of uniformly processed single-cell data from pediatric cancer tumors and ...
JavaScript · 4 stelle
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cranlock
Lock our R dependencies to specific versions.
Python · 2 stelle
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ScPCAr
An R package for interacting with the ScPCA Portal API
R · 2 stelle
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OpenScPCA-nf
A workflow for running OpenScPCA analysis modules
R · 2 stelle
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refinebio-design
Design files and resources for refine.bio
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scRNA-seq_sandbox
Exploring some scRNA-seq methodologies, not a full-fledged pipeline ready for use
R · 1 stella
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refinebio-docs
User Documentation for refine.bio
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fancySVD
Only the IterativeSVD algorithm from iskandr/fancyimpute to make dependency resolution easier.
Python · 1 stella
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refinebio-py
A python client for the refine.bio API.
Python · 1 stella
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Python · 1 stella
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refinebio-web
Refinebio Web
JavaScript · 1 stella
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R · 1 stella
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reproducible-research
Repository for Reproducible Research Practices Training Workshop
HTML · 1 stella
- 16 altri repository si trovano su Vedi su GitHub
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ci OpenScPCA admin
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100
AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1436 ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
AlexsLemonade/training-modules#1095 · 2 commenti ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Monthly spellcheck resultsApertaOpenScPCA admin spelling
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100
AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1434 ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
AlexsLemonade/scpca-nf#1346 ·
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Stand up CCDI mapping for dynamic responsesForse di nuovo libera @davidsmejia l’ha presa 32 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/scpca-portal#2090 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Compare Outputs of Feature Dev Stack and Staging Data LoadingForse di nuovo libera @avrohomgottlieb l’ha presa 33 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/scpca-portal#2087 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Create an individual metaprogram reportForse di nuovo libera @allyhawkins l’ha presa 36 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/metafactory#23 · 1 assegnatario ·
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Add Additional Processing Table Row in READMEForse di nuovo libera @nozomione l’ha presa 36 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. ApertaAPI
AlexsLemonade/scpca-portal#2083 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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CCDI node: implement the static, config-driven endpointsForse di nuovo libera @davidsmejia l’ha presa 46 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/scpca-portal#2072 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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CCDI node: vendor & pin the v1.3.0 spec, generate types, serve node OpenAPIForse di nuovo libera @davidsmejia l’ha presa 46 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/scpca-portal#2071 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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CCDI node: scaffold the sequestered module behind a dark-by-default toggleForse di nuovo libera @davidsmejia l’ha presa 46 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/scpca-portal#2070 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100
AlexsLemonade/scpca-nf#1332 ·
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AlexsLemonade/scpca-portal#2067 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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API
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100
AlexsLemonade/scpca-portal#2063 ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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analysis
AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1424 · 1 commento · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
AlexsLemonade/scpca-nf#1325 ·
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Indicate that doublet columns will be NA if scDblFinder failedForse di nuovo libera @allyhawkins l’ha presa 64 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/scpca-docs#514 · 1 assegnatario ·
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Remove legacy code in loadable-resource feature branchForse di nuovo libera @avrohomgottlieb l’ha presa 75 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/scpca-portal#2048 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Add script to train SingleR modelForse di nuovo libera @allyhawkins l’ha presa 36 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Apertaanalysis
AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1414 · 1 assegnatario ·
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Add script to prepare references for useForse di nuovo libera @allyhawkins l’ha presa 39 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Apertaanalysis
AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1413 · 1 commento · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 74/100
AlexsLemonade/ScPCAr#55 · 1 commento ·
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Add an additional field on Project Page to describe any additional analysis outputsForse di nuovo libera @nozomione l’ha presa 36 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Apertaclient / front-end
AlexsLemonade/scpca-portal#2014 · 2 commenti · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Epic
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
AlexsLemonade/scpca-portal#2001 ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Epic
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
AlexsLemonade/scpca-portal#2000 ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 70/100
AlexsLemonade/training-modules#1016 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Swap size -> linewidthAperta
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100
AlexsLemonade/training-modules#1015 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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RFC: Upgrade Elasticsearch to OpenSearch 3.xForse di nuovo libera @davidsmejia l’ha presa 117 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/refinebio#3597 · 1 assegnatario ·
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Epic
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 38/100
AlexsLemonade/training-modules#1014 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Restore production data flowApertaEpic
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
AlexsLemonade/refinebio#3595 ·
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Add Mypy Type Hinting to Serializers and ViewsForse di nuovo libera @avrohomgottlieb l’ha presa 117 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/scpca-portal#1994 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Modernize InfrastructureApertaEpic
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
AlexsLemonade/refinebio#3594 ·
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Epic
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
AlexsLemonade/scpca-portal#1991 ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Automate Data LoadingApertaEpic
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
AlexsLemonade/scpca-portal#1990 ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Epic
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
AlexsLemonade/scpca-portal#1989 ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Use newest models in packageApertaEpic
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
AlexsLemonade/mbSSP#37 ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100
AlexsLemonade/scpca-portal#1976 ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Improve documentation for datasets API endpointsForse di nuovo libera @davidsmejia l’ha presa 128 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. ApertaAPI documentation
AlexsLemonade/scpca-portal#1975 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Add Mypy to Pre-CommitForse di nuovo libera @avrohomgottlieb l’ha presa 130 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/scpca-portal#1973 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Job Historical Data improvementForse di nuovo libera @nozomione l’ha presa 130 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. ApertaAPI
AlexsLemonade/scpca-portal#1970 · 1 commento · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Medium Priority
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 58/100
AlexsLemonade/scpca-portal#1969 ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 72/100
AlexsLemonade/training-modules#997 · 3 commenti ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Upgrade Elasticsearch to OpenSearch 3.xForse di nuovo libera @davidsmejia l’ha presa 144 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/refinebio#3576 · 1 assegnatario ·
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Upgrade to Django 5.2Forse di nuovo libera @davidsmejia l’ha presa 144 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/refinebio#3575 · 1 assegnatario ·
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Consolidate download token forms for CCDL and User datasetsForse di nuovo libera @nozomione l’ha presa 148 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Apertaclient / front-end
AlexsLemonade/scpca-portal#1954 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100
AlexsLemonade/training-modules#991 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 52/100
AlexsLemonade/scpca-nf#1279 · 1 commento ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 66/100
AlexsLemonade/refinebio#3564 ·
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Add Static Analysis With MypyForse di nuovo libera @avrohomgottlieb l’ha presa 159 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
AlexsLemonade/scpca-portal#1944 · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 68/100
AlexsLemonade/scpca-portal#1942 ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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Create empty state when filters return 0 projectsForse di nuovo libera @dvenprasad l’ha presa 159 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. ApertaLow Priority
AlexsLemonade/scpca-portal#1940 · 1 commento · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 8 giorni
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