Error reading Xenium data: morphology file missing
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评估
调研方向
首先，使用此处描述的 Xenium Onboard Analysis 4.0.0 数据集，通过 spatialdata_io.xenium() 重现故障，然后将行为与 issue #361 进行比较。跟踪 reader 如何定位形态图像；当包含 morphology.ome.tif 的数据集无需查找 morphology_mip.ome.tif 即可读取时，即表示完成。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
While trying to read Xenium data with spatialdata_io.xenium(), I get the following error:
The file "path/to/xenium/data/morphology_mip.ome.tif" does not exist.
Inspecting the folder shows that the file is actually named:
morphology.ome.tif
The dataset and software versions are the same as in issue #361:
spatialdata_ioversion: 0.6.0- Xenium platform: Xenium Onboard Analysis 4.0.0
- 主要语言
- Python
- 星标
- 105
- 派生
- 64
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
环境准备
- 没有 Dockerfile 或 Docker Compose 文件
- 没有 Pull Request 模板
- 阅读贡献指南
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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