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ilastik

已索引 9 个仓库 · 在 GitHub 查看

ilastik
ilastik-shell, applets, and workflows to string them together.

Python · 408 个 star
marching_cubes
Standalone marching cubes implementation and Python bindings

C++ · 101 个 star
volumina
Volume Slicing and Editing

Python · 34 个 star
tiktorch
Tiktorch

Python · 12 个 star
ilastik-conda-recipes
Conda recipes for building ilastik dependencies.

Shell · 9 个 star
app-pass
Fix common issues in Mach-O binaries for notarization

Python · 4 个 star
ilastik.github.io

HTML · 3 个 star
hytra
Python module for multi HYpotheses TRAcking

Python · 2 个 star
publish-conda-stack
Scripts to update our published conda packages when our recipes have changed.

Python · 0 个 star

适合新手全部

未关闭全部

Multicut: wsdt: invert probabilities checkbox not deserialized 未关闭

bug good first issue multicut serialization

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 70/100

ilastik/ilastik#3252 · 2026年9月24日创建
Object Classisification - multi-lane UI feature count after subset features off 未关闭

gui objectClassification

难度 3/5 1-2 天新手友好度 65/100

ilastik/ilastik#3251 · 2026年9月24日创建
1.4.2 Linux bundle ships libglvnd without a vendor driver, no GL context on software-rendered remote desktops 未关闭

awaiting_input ilastik-binary-dist os:linux

ilastik/ilastik#3242 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2026年8月25日创建
Carving: Show completed segments in 3D per default 未关闭

carving feature-request gui

ilastik/ilastik#3239 · 3 条评论 · 已指派 1 人 · 2026年8月7日创建
Carving: current object saved/loaded after committing object and saving project 未关闭

bug carving

难度 3/5 1-2 天新手友好度 58/100

ilastik/ilastik#3238 · 1 条评论 · 2026年8月7日创建
Opening ome-zarr (v0.4) in Ilastik failed change in level 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 58/100

ilastik/ilastik#3236 · 1 条评论 · 1 个 reaction · 2026年8月6日创建
Trying to overwrite locked project file corrupts it 未关闭

bug shell

难度 4/5 3-5 天新手友好度 55/100

ilastik/ilastik#3235 · 1 条评论 · 2026年8月6日创建
Update Carousel Screenshots 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 55/100

ilastik/ilastik.github.io#346 · 1 个 reaction · 2026年5月15日创建
Set channels for classification 未关闭

feature-request

难度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

ilastik/ilastik#3209 · 1 条评论 · 1 个 reaction · 2026年5月9日创建
headless mode processing a specific resolution level 未关闭

bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 50/100

ilastik/ilastik#3208 · 3 条评论 · 2026年5月8日创建
Mobile app 未关闭

feature-request

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

ilastik/ilastik#3205 · 2 条评论 · 2026年4月30日创建
Rethink the use of the term "Applet" in the docs 未关闭

难度 2/5 半天新手友好度 55/100

ilastik/ilastik.github.io#342 · 1 条评论 · 2026年4月9日创建
NNWorkflow Progressbar when downloading goes over 100% sometimes 未关闭

nnClassification

难度 3/5 1-2 天新手友好度 38/100

ilastik/ilastik#3166 · 7 条评论 · 2026年3月20日创建
ImageView2D_tests start getting flaky 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 30/100

ilastik/volumina#351 · 2026年3月16日创建
CI: add deploy to pypi in preparation for move to conda-forge 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 20/100

ilastik/tiktorch#240 · 2026年2月24日创建
Multicut: segmentation faults possible during block-wise watershed 未关闭

bug cross-platform multicut

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

ilastik/ilastik#3153 · 1 条评论 · 2026年2月23日创建
Progress bar in batch processing is way off 未关闭

batch good first issue gui

难度 3/5 1-2 天新手友好度 55/100

ilastik/ilastik#3151 · 7 条评论 · 2026年2月11日创建
Investigate pyqtgraph becoming not functional in ilastik since 0.14.0 未关闭

cross-platform dependencies

难度 4/5 3-5 天新手友好度 28/100

ilastik/ilastik#3149 · 2026年2月5日创建
Refactor/Rethink MetaDict: better documentation / type hints for standard keys 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

ilastik/ilastik#3133 · 6 条评论 · 2026年1月12日创建
Axis units should use normalised terms 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

ilastik/ilastik#3129 · 4 条评论 · 2026年1月9日创建
Histogram for adjusting levels from the button 未关闭

ilastik/ilastik#3128 · 1 个 reaction · 已指派 1 人 · 2026年1月8日创建
Debugging the deployment pipeline / Disable pushes to main 未关闭

CI discussion

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

ilastik/ilastik#3123 · 1 条评论 · 2025年12月22日创建
Any operator with a cache deep inside needs to implement `_setInSlot(...): pass`... 未关闭

lazyflow

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

ilastik/ilastik#3121 · 2025年12月22日创建
entitlements bundle missing some of Python's entitlements 未关闭

难度 1/5 1 小时以内新手友好度 55/100

ilastik/app-pass#18 · 1 条评论 · 2025年12月15日创建
Add note about first startup times on win (and mac) to installation instructions 未关闭

难度 1/5 1 小时以内新手友好度 55/100

ilastik/ilastik.github.io#324 · 2025年11月20日创建
Prediction Mask allows float image (but then throws errors) 未关闭

easyFix enhancement good first issue pixelClassification

ilastik/ilastik#3104 · 4 条评论 · 已指派 1 人 · 2025年11月6日创建
Forward compatibility with new export formats 未关闭

data-export

难度 3/5 1-2 天新手友好度 48/100

ilastik/ilastik#3100 · 2 条评论 · 2025年11月4日创建
Drange update fails in export op when adding small dataset 未关闭

bug data-export data-selection

难度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

ilastik/ilastik#3097 · 2025年11月3日创建
Should prevent adding ome-zarr via "Add single file" 未关闭

data-selection feature-request multiscale

难度 4/5 3-5 天新手友好度 42/100

ilastik/ilastik#3095 · 2 条评论 · 2025年10月31日创建
Tests: (rare?) segfault 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 20/100

ilastik/volumina#341 · 2025年10月13日创建
Window leveling does not work in Autocontext pixel classification at 2nd stage of training 未关闭

bug

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

ilastik/ilastik#3083 · 2 条评论 · 2025年10月13日创建
deps: investigate recent pytorch-3Dunet changes, dependency updates 未关闭

dependencies

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

ilastik/ilastik#3079 · 2025年10月6日创建
Export dialog allows cropping to sizes that volumina can't handle 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

ilastik/volumina#336 · 2025年9月26日创建
Add tda to docs start 未关闭

难度 1/5 1 小时以内新手友好度 50/100

ilastik/ilastik.github.io#321 · 2025年9月26日创建
Export image settings dialog cannot handle lanes with different axes 未关闭

data-export

难度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

ilastik/ilastik#3071 · 3 条评论 · 2025年9月16日创建
Nickname for multiscales when path is given explicitly 未关闭

easyFix good first issue multiscale

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

ilastik/ilastik#3067 · 10 条评论 · 2025年9月9日创建
IndexError during Save Project As 未关闭

data-selection

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

ilastik/ilastik#3062 · 2 条评论 · 2025年8月28日创建
ilastik not showing images with current development env on linux 未关闭

bug dependencies os:linux

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

ilastik/ilastik#3054 · 2025年8月13日创建
openGL not working on linux, with certain dependencies (as in the current ilastik development env) 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

ilastik/volumina#331 · 3 条评论 · 2025年8月13日创建
Chore: remove cplex code paths from tracking 未关闭

tracking

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

ilastik/ilastik#3051 · 2025年8月8日创建
Tracking fails if there are empty frames 未关闭

tracking

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

ilastik/ilastik#3050 · 2025年8月7日创建
Can't adjust thresholds on float images 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 48/100

ilastik/volumina#329 · 2025年8月1日创建
Suggest Features - wrapper method - very slow 未关闭

pixelClassification

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

ilastik/ilastik#3046 · 2025年7月25日创建
ilastik crashes when starting neural network classification (local) 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 30/100

ilastik/ilastik#3044 · 2 条评论 · 2025年7月16日创建
Assess impact of smaller antialiasing sigmas for large scaling steps 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

ilastik/ilastik#3037 · 2025年7月1日创建
zarr v3 support please 未关闭

multiscale

难度 5/5 一周以上新手友好度 30/100

ilastik/ilastik#3033 · 2 条评论 · 2025年6月20日创建
Fixing file paths during project load modifies ilp even in case of error 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 42/100

ilastik/ilastik#3031 · 1 个 reaction · 2025年6月20日创建
Force making a new .h5 file from cli or auto-remove h5 file 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 38/100

ilastik/ilastik#3030 · 1 条评论 · 2025年6月13日创建
Wishlist: Features to utilise pixel sizes once available 未关闭

feature-request

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

ilastik/ilastik#3029 · 3 条评论 · 2025年6月12日创建
Layer export defaults to ilastik executable path 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 42/100

ilastik/ilastik#3026 · 1 个 reaction · 2025年6月4日创建

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