Proprietario

ilastik

9 repository indicizzati · Vedi su GitHub

ilastik
ilastik-shell, applets, and workflows to string them together.

Python · 408 stelle
marching_cubes
Standalone marching cubes implementation and Python bindings

C++ · 101 stelle
volumina
Volume Slicing and Editing

Python · 34 stelle
tiktorch
Tiktorch

Python · 12 stelle
ilastik-conda-recipes
Conda recipes for building ilastik dependencies.

Shell · 9 stelle
app-pass
Fix common issues in Mach-O binaries for notarization

Python · 4 stelle
ilastik.github.io

HTML · 3 stelle
hytra
Python module for multi HYpotheses TRAcking

Python · 2 stelle
publish-conda-stack
Scripts to update our published conda packages when our recipes have changed.

Python · 0 stelle

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

Multicut: wsdt: invert probabilities checkbox not deserialized Aperta

bug good first issue multicut serialization

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 70/100

ilastik/ilastik#3252 · Aperta il 24/9/2026
Object Classisification - multi-lane UI feature count after subset features off Aperta

gui objectClassification

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 65/100

ilastik/ilastik#3251 · Aperta il 24/9/2026
1.4.2 Linux bundle ships libglvnd without a vendor driver, no GL context on software-rendered remote desktops Aperta

awaiting_input ilastik-binary-dist os:linux

ilastik/ilastik#3242 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 25/8/2026
Carving: Show completed segments in 3D per default Aperta

carving feature-request gui

ilastik/ilastik#3239 · 3 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 7/8/2026
Carving: current object saved/loaded after committing object and saving project Aperta

bug carving

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 58/100

ilastik/ilastik#3238 · 1 commento · Aperta il 7/8/2026
Opening ome-zarr (v0.4) in Ilastik failed change in level Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 58/100

ilastik/ilastik#3236 · 1 commento · 1 reazione · Aperta il 6/8/2026
Trying to overwrite locked project file corrupts it Aperta

bug shell

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 55/100

ilastik/ilastik#3235 · 1 commento · Aperta il 6/8/2026
Update Carousel Screenshots Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100

ilastik/ilastik.github.io#346 · 1 reazione · Aperta il 15/5/2026
Set channels for classification Aperta

feature-request

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

ilastik/ilastik#3209 · 1 commento · 1 reazione · Aperta il 9/5/2026
headless mode processing a specific resolution level Aperta

bug

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 50/100

ilastik/ilastik#3208 · 3 commenti · Aperta il 8/5/2026
Mobile app Aperta

feature-request

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

ilastik/ilastik#3205 · 2 commenti · Aperta il 30/4/2026
Rethink the use of the term "Applet" in the docs Aperta

Difficoltà 2/5 Mezza giornata Idoneità per principianti 55/100

ilastik/ilastik.github.io#342 · 1 commento · Aperta il 9/4/2026
NNWorkflow Progressbar when downloading goes over 100% sometimes Aperta

nnClassification

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 38/100

ilastik/ilastik#3166 · 7 commenti · Aperta il 20/3/2026
ImageView2D_tests start getting flaky Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

ilastik/volumina#351 · Aperta il 16/3/2026
CI: add deploy to pypi in preparation for move to conda-forge Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

ilastik/tiktorch#240 · Aperta il 24/2/2026
Multicut: segmentation faults possible during block-wise watershed Aperta

bug cross-platform multicut

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

ilastik/ilastik#3153 · 1 commento · Aperta il 23/2/2026
Progress bar in batch processing is way off Aperta

batch good first issue gui

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100

ilastik/ilastik#3151 · 7 commenti · Aperta il 11/2/2026
Investigate pyqtgraph becoming not functional in ilastik since 0.14.0 Aperta

cross-platform dependencies

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 28/100

ilastik/ilastik#3149 · Aperta il 5/2/2026
Refactor/Rethink MetaDict: better documentation / type hints for standard keys Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

ilastik/ilastik#3133 · 6 commenti · Aperta il 12/1/2026
Axis units should use normalised terms Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

ilastik/ilastik#3129 · 4 commenti · Aperta il 9/1/2026
Histogram for adjusting levels from the button Aperta

ilastik/ilastik#3128 · 1 reazione · 1 assegnatario · Aperta il 8/1/2026
Debugging the deployment pipeline / Disable pushes to main Aperta

CI discussion

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

ilastik/ilastik#3123 · 1 commento · Aperta il 22/12/2025
Any operator with a cache deep inside needs to implement `_setInSlot(...): pass`... Aperta

lazyflow

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

ilastik/ilastik#3121 · Aperta il 22/12/2025
entitlements bundle missing some of Python's entitlements Aperta

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 55/100

ilastik/app-pass#18 · 1 commento · Aperta il 15/12/2025
Add note about first startup times on win (and mac) to installation instructions Aperta

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 55/100

ilastik/ilastik.github.io#324 · Aperta il 20/11/2025
Prediction Mask allows float image (but then throws errors) Aperta

easyFix enhancement good first issue pixelClassification

ilastik/ilastik#3104 · 4 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 6/11/2025
Forward compatibility with new export formats Aperta

data-export

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

ilastik/ilastik#3100 · 2 commenti · Aperta il 4/11/2025
Drange update fails in export op when adding small dataset Aperta

bug data-export data-selection

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

ilastik/ilastik#3097 · Aperta il 3/11/2025
Should prevent adding ome-zarr via "Add single file" Aperta

data-selection feature-request multiscale

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 42/100

ilastik/ilastik#3095 · 2 commenti · Aperta il 31/10/2025
Tests: (rare?) segfault Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

ilastik/volumina#341 · Aperta il 13/10/2025
Window leveling does not work in Autocontext pixel classification at 2nd stage of training Aperta

bug

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

ilastik/ilastik#3083 · 2 commenti · Aperta il 13/10/2025
deps: investigate recent pytorch-3Dunet changes, dependency updates Aperta

dependencies

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

ilastik/ilastik#3079 · Aperta il 6/10/2025
Export dialog allows cropping to sizes that volumina can't handle Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

ilastik/volumina#336 · Aperta il 26/9/2025
Add tda to docs start Aperta

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 50/100

ilastik/ilastik.github.io#321 · Aperta il 26/9/2025
Export image settings dialog cannot handle lanes with different axes Aperta

data-export

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

ilastik/ilastik#3071 · 3 commenti · Aperta il 16/9/2025
Nickname for multiscales when path is given explicitly Aperta

easyFix good first issue multiscale

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

ilastik/ilastik#3067 · 10 commenti · Aperta il 9/9/2025
IndexError during Save Project As Aperta

data-selection

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

ilastik/ilastik#3062 · 2 commenti · Aperta il 28/8/2025
ilastik not showing images with current development env on linux Aperta

bug dependencies os:linux

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

ilastik/ilastik#3054 · Aperta il 13/8/2025
openGL not working on linux, with certain dependencies (as in the current ilastik development env) Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

ilastik/volumina#331 · 3 commenti · Aperta il 13/8/2025
Chore: remove cplex code paths from tracking Aperta

tracking

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

ilastik/ilastik#3051 · Aperta il 8/8/2025
Tracking fails if there are empty frames Aperta

tracking

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

ilastik/ilastik#3050 · Aperta il 7/8/2025
Can't adjust thresholds on float images Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

ilastik/volumina#329 · Aperta il 1/8/2025
Suggest Features - wrapper method - very slow Aperta

pixelClassification

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

ilastik/ilastik#3046 · Aperta il 25/7/2025
ilastik crashes when starting neural network classification (local) Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

ilastik/ilastik#3044 · 2 commenti · Aperta il 16/7/2025
Assess impact of smaller antialiasing sigmas for large scaling steps Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

ilastik/ilastik#3037 · Aperta il 1/7/2025
zarr v3 support please Aperta

multiscale

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

ilastik/ilastik#3033 · 2 commenti · Aperta il 20/6/2025
Fixing file paths during project load modifies ilp even in case of error Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 42/100

ilastik/ilastik#3031 · 1 reazione · Aperta il 20/6/2025
Force making a new .h5 file from cli or auto-remove h5 file Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100

ilastik/ilastik#3030 · 1 commento · Aperta il 13/6/2025
Wishlist: Features to utilise pixel sizes once available Aperta

feature-request

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

ilastik/ilastik#3029 · 3 commenti · Aperta il 12/6/2025
Layer export defaults to ilastik executable path Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 42/100

ilastik/ilastik#3026 · 1 reazione · Aperta il 4/6/2025

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