Visualization: if column 'XValues' not provided and multiple conditions should be plotted automatically
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评估
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 新手友好度
- 45/100
- Issue 类型
- 功能
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活跃度
- 停滞
- 技术栈
- python
调研方向
Start with the visualization-table handling for the XValues column, then review how measurement time and the first condition-file column currently select plots. Use the PEtab-dev/PEtab#283 conversation and the linked supplementary example as context. Done means automatically plotting all conditions, including multiple dose-response subplots when XValues is absent.
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
If in the visualization table, the column XValues is not provided, it is inferred:
- if in measurement file measurement time is not constant, then XValues = 'time' ->plot time course
- if its constant, then dose response plots are plotted. For now, only the first column in the condition file is taken into account.
Expand to automatically plot all conditions. Ideally like subplots B and C in:
https://journals.plos.org/ploscompbiol/article/file?type=supplementary&id=info:doi/10.1371/journal.pcbi.1007147.s005
see conversation in PEtab-dev/PEtab#283.
- 主要语言
- Python
- 星标
- 18
- 派生
- 9
- 平均合并
- 1 天 8 小时
- 30 天内合并 PR
- 21
环境准备
- 没有 Dockerfile 或 Docker Compose 文件
- 没有 Pull Request 模板
- 阅读贡献指南
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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`petab1to2`: random column name for pre-existing `experimentId` column可能已有人在做 关联的 PR 仍在进行中或已合并。 未关闭
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