Visualization: if column 'XValues' not provided and multiple conditions should be plotted automatically
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評估
- 難度
- 4/5
- 預估耗時
- 3-5 天
- 新手友好度
- 45/100
- Issue 類型
- 功能
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活躍度
- 停滯
- 技術堆疊
- python
研究方向
Start with the visualization-table handling for the XValues column, then review how measurement time and the first condition-file column currently select plots. Use the PEtab-dev/PEtab#283 conversation and the linked supplementary example as context. Done means automatically plotting all conditions, including multiple dose-response subplots when XValues is absent.
由索引模型根據 Issue 內容生成。
描述
If in the visualization table, the column XValues is not provided, it is inferred:
- if in measurement file measurement time is not constant, then XValues = 'time' ->plot time course
- if its constant, then dose response plots are plotted. For now, only the first column in the condition file is taken into account.
Expand to automatically plot all conditions. Ideally like subplots B and C in:
https://journals.plos.org/ploscompbiol/article/file?type=supplementary&id=info:doi/10.1371/journal.pcbi.1007147.s005
see conversation in PEtab-dev/PEtab#283.
- 主要語言
- Python
- 星號
- 18
- 分支
- 9
- 平均合併
- 1 天 21 小時
- 30 天內合併 PR
- 25
環境準備
- 沒有 Dockerfile 或 Docker Compose 檔案
- 沒有 Pull Request 範本
- 閱讀貢獻指南
從這裡開始
- 先讀完整個 Issue，再讀專案的貢獻指南。
- 在 Issue 下留言說明你要接手 —— 這能避免兩個人做同樣的事。
- Fork 儲存庫，在一個分支上完成修改。
- 送出 Pull Request，並在描述裡引用這個 Issue 編號。
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