Atom numbering: one convention (from 1) in every place ECCE shows an atom number
@ohlincha 已经在做这个了。
开始于 2026年10月26日。
评估
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描述
9.4.0 test (Andy): the viewer's selection status line said N8 where the Density Profile list says N9; the status line printed TAtm::index(), which counts from 0 (unchanged since PNNL; fixed on main to count from 1). Audit every user-visible atom number for the same mistake: viewer status line and atom labels, Measure (distances/angles/torsions), Geometry Constraints, Z-matrix/geometry tables, Mulliken/ESP charge tables, MO composition and MO Diagram fragments, Density Map/Profile lists, vibration Mode/Composition coordinates ('C2–C3–C4 bend') and the 'Add coordinates (atom numbers)' entry, Builder script hooks that take atom numbers, input decks' comments, exports (.csv). List each place with its convention, fix every 0-based one to count from 1 (Builder.C:3328 pattern: index() + 1), and add a test that one atom of one molecule carries the same number in the status line, labels, a charge table and the Density Profile list.
- 主要语言
- C
- 星标
- 10
- 派生
- 8
- 平均合并
- 2 小时 7 分钟
- 30 天内合并 PR
- 4
环境准备
这个项目没有提供开发容器、Dockerfile 或贡献指南，环境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步骤见我们的新手贡献指南。
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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