DiODeProject/MuMoT

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Multiscale Modelling Tool - mathematical modelling without the maths

星标: 24
派生: 5
开放的新手 issue: 0
已索引 issue: 59

主要语言: Python
许可证: GPL-3.0
最近 GitHub push: 2022年3月18日
最近索引: 2026年9月15日
贡献指南: 没有贡献指南
行为准则: 没有行为准则
新手标签: help wanted good first issue
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Add CFF file to make it easier for others to cite MuMoT 未关闭

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 35/100

DiODeProject/MuMoT#412 · 1 条评论 · 2021年7月28日创建
Changing visualisation type of MuMoTstochasticSimulationViews through GUI causes plot deformations (squeezing) 未关闭

bug

DiODeProject/MuMoT#409 · 已指派 1 人 · 2020年6月29日创建
Intermittently hitting cell execution timeout of 120 seconds 未关闭

bug testing

难度 3/5 1-2 天新手友好度 30/100

DiODeProject/MuMoT#407 · 2 条评论 · 2020年6月2日创建
Use of bare 'except:' is bad 未关闭

bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

DiODeProject/MuMoT#387 · 1 条评论 · 2020年2月14日创建
Multicontroller do not accept some of the plotting parameters that normal controllers support 未关闭

bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

DiODeProject/MuMoT#385 · 2020年2月14日创建
Do not suppress tracebacks when running 'test' notebooks via nbval 未关闭

enhancement testing

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

DiODeProject/MuMoT#384 · 3 条评论 · 2020年2月10日创建
Configure logging via 'logging' module 未关闭

enhancement testing

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

DiODeProject/MuMoT#383 · 2020年2月10日创建
model2.showODEs(method='vanKampen') -> IndexError: list index out of range 未关闭

bug testing

DiODeProject/MuMoT#377 · 7 条评论 · 已指派 2 人 · 2020年2月3日创建
Switch to using matplotlib's object-oriented API 未关闭

enhancement question

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

DiODeProject/MuMoT#367 · 1 条评论 · 2019年10月1日创建
Reduce runtime of CI jobs? 未关闭

enhancement question

难度 5/5 一周以上新手友好度 20/100

DiODeProject/MuMoT#366 · 2019年10月1日创建
Muticontroller plot warning 未关闭

warning

DiODeProject/MuMoT#355 · 1 条评论 · 已指派 1 人 · 2019年9月28日创建
Multicontrollers missing some advanced options 未关闭

bug

难度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

DiODeProject/MuMoT#353 · 2019年9月27日创建
Clean exceptions 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

DiODeProject/MuMoT#352 · 3 条评论 · 2019年9月27日创建
Add unit tests 未关闭

testing

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

DiODeProject/MuMoT#339 · 2019年8月20日创建
Visualise noise in 3d stream plot 未关闭

enhancement

DiODeProject/MuMoT#336 · 已指派 2 人 · 2019年8月9日创建
Document 1d and 3d stream plots 未关闭

documentation

DiODeProject/MuMoT#335 · 已指派 1 人 · 2019年8月9日创建
Replace global var figcounter with matplotlib.pyplot.get_fignums()? 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

DiODeProject/MuMoT#333 · 1 条评论 · 2019年8月9日创建
1d stream plot does not appear in full after re-generation using sliders 未关闭

bug help wanted

难度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

DiODeProject/MuMoT#329 · 2019年7月23日创建
Add type hints 未关闭

enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 30/100

DiODeProject/MuMoT#328 · 2019年7月23日创建
Update contributors 未关闭

documentation

DiODeProject/MuMoT#327 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2019年7月22日创建
Enhance random walk computation 未关闭

enhancement

DiODeProject/MuMoT#326 · 已指派 1 人 · 2019年7月22日创建
Test suite: run all notebooks in one or more dirs rather than explicitly named notebooks 未关闭

enhancement testing

DiODeProject/MuMoT#325 · 9 条评论 · 已指派 1 人 · 2019年7月17日创建
Greek letters should be used consistently in all functions 未关闭

DiODeProject/MuMoT#324 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2019年7月2日创建
Consider pointing binder icon to latest release branch 未关闭

documentation enhancement question

DiODeProject/MuMoT#320 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2019年4月4日创建
Consider DOI release assignment strategy 未关闭

documentation question

难度 4/5 3-5 天新手友好度 30/100

DiODeProject/MuMoT#319 · 1 条评论 · 2019年4月4日创建
Implement custom download results widget 未关闭

enhancement

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

DiODeProject/MuMoT#308 · 2019年3月22日创建
Enable result download for non-stochastic simulation views 未关闭

enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

DiODeProject/MuMoT#305 · 2019年3月21日创建
Check advanced multicontroller bookmarks 未关闭

bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 62/100

DiODeProject/MuMoT#292 · 2019年3月4日创建
aggregateResults toggle in MuMoTfieldController should only trigger replotting without re-computing all data 未关闭

enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 20/100

DiODeProject/MuMoT#284 · 2019年2月28日创建
MuMoTfieldController should include the toggle 'plotProportions' as most other controllers do 未关闭

enhancement

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

DiODeProject/MuMoT#283 · 2019年2月28日创建
showNoise in MuMoTfieldControllers should be treated as all other parameters and a widget created accordingly 未关闭

enhancement

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

DiODeProject/MuMoT#282 · 2019年2月28日创建
remove MuMoTcontroller._plotLimitsWidget and use the self._widgetsExtraParams['plotLimits'] 未关闭

enhancement

难度 3/5 1-2 天新手友好度 30/100

DiODeProject/MuMoT#281 · 4 条评论 · 2019年2月28日创建
Implement more sophisticated analytic and numerical noise solutions / approximations 未关闭

enhancement help wanted

难度 5/5 一周以上新手友好度 20/100

DiODeProject/MuMoT#251 · 2019年1月11日创建
Implement model cell bookmarking 未关闭

enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

DiODeProject/MuMoT#244 · 2018年12月19日创建
Bifurcation() fails to find all branches 未关闭

help wanted question

DiODeProject/MuMoT#228 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2018年11月26日创建
SSA multiple runs plots: change box plots for shaded confidence intervals 未关闭

enhancement

DiODeProject/MuMoT#227 · 已指派 1 人 · 2018年11月26日创建
Expand options for types of graphs in multiagent() network topology 未关闭

enhancement

DiODeProject/MuMoT#226 · 已指派 1 人 · 2018年11月26日创建
Feature request: support for 2-simplex (ternary) plot 未关闭

enhancement

DiODeProject/MuMoT#225 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2018年11月26日创建
Feature request: create and save animated gif of multiagent or SSA runtime plots 未关闭

enhancement

DiODeProject/MuMoT#224 · 已指派 1 人 · 2018年11月26日创建
Allow substitute() to perform simple reactants scaling and time scaling 未关闭

enhancement

DiODeProject/MuMoT#222 · 已指派 1 人 · 2018年11月26日创建
Stream lines shading should be scaled to avoid barely visible stream lines 未关闭

enhancement

DiODeProject/MuMoT#218 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2018年11月26日创建
Add figures based on parameter sweeps of numerical simulations 未关闭

enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 30/100

DiODeProject/MuMoT#212 · 2018年10月25日创建
Use parser library in parseModel 未关闭

enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

DiODeProject/MuMoT#199 · 1 条评论 · 2018年10月10日创建
Readthedocs should open external sites in new browser windows 未关闭

documentation enhancement

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 42/100

DiODeProject/MuMoT#198 · 2 条评论 · 2018年10月10日创建
Use nbval to perform regression testing on MuMoTtest.ipynb 未关闭

enhancement testing

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

DiODeProject/MuMoT#187 · 2018年10月10日创建
Add plot of noise spectrum from noise solutions 未关闭

enhancement

DiODeProject/MuMoT#165 · 已指派 1 人 · 2018年8月2日创建
LaTeX in output cells slow to render 未关闭

bug

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

DiODeProject/MuMoT#162 · 2018年8月1日创建
Allow for creating models from Python strings 未关闭

enhancement good first issue

DiODeProject/MuMoT#156 · 6 条评论 · 已指派 1 人 · 2018年7月25日创建
Allow multicontrollers to encapsulate multiple models 未关闭

enhancement

DiODeProject/MuMoT#141 · 已指派 1 人 · 2018年6月9日创建
The dropdown widget of MuMoTstochasticSimulationController for the Final distribution visualisation does not render latex correctly 未关闭

wontfix

难度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

DiODeProject/MuMoT#136 · 1 条评论 · 2018年5月26日创建

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